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Korean Institute of Information Scientists and Engineers 한국정보과학회 학술발표논문집 한국정보과학회 1997년도 가을 학술발표논문집 제24권 제2호(Ⅱ)
발행연도
1997.10
수록면
154 - 157 (4page)

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다중 유전자 배치는 RNA이차원 구조를 밝혀하는 유용한 기법이다. 본 논문에서는 RNA유전자의 이차원 구조를 확인하기위해서 RNA유전자들을 다중배치하는 알고리즘을 제안한다. 이 알고리즘에서 RNA 유전자내에서 가능성이 있는 이차원 구조를 확인하기위해 유전자 자체 비교에 의한 dot matrix가 사용되었다. dot matrix에 대해서 hit probability가 계산되었으며, 이 hit probabiltity에 근거하여 비용함수가 정의되었다. 이 비용함수를 최소화하기 위해 simulated annealing 기법이 적용되었다. Simulated annealing에 사용되는 계산시간을 줄이기 위하여 몇가지의 전략이 사용되었다. 또한 최소비용에 더 빠르게 수렴할 수 있도록 하는 transition rule이 적용되었다. 이 알고리즘이 RNA유전자내의 가능한 이차원 구조를 밝혀내기위해 실제의 RNA 유전자에 적용되었다.

목차

요약

1. 서론

2. 기본 정의

3. 알고리즘

4. 실험결과

5. 결론

참고 문헌

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