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논문 기본 정보
- 자료유형
- 학술저널
- 저자정보
- 저널정보
- Korean Institute of Information Scientists and Engineers 정보과학회논문지 : 소프트웨어 및 응용 정보과학회논문지 : 소프트웨어 및 응용 제36권 제10호
- 발행연도
- 2009.10
- 수록면
- 786 - 792 (7page)
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지지벡터기계는 자료간의 유사도를 커널함수를 사용하여 계산하고, 이러한 유사도를 이용하여 패턴을 분류하는 최적인 초평면을 구한다. 따라서 자료의 특성을 효과적으로 반영할 수 있는 유사도의 사용이 중요하다. 본 연구에서는 아미노산 서열간의 최적의 유사도를 얻기 위해서, 아미노산의 진화적인 관계와 소수성으로부터 유도된 메트릭을 실수 지수를 가지는 형태로 일반화하였다. 제안한 메트릭이 메트릭의 조건을 만족하고, 아미노산 서열과 DNA 서열의 유사도를 계산하기 위해서 널리 사용되는 스트링 커널 내에서 이용되는 메트릭과의 관련성을 알아본다. 또한, 적용하려는 문제에 보다 효과적인 메트릭을 일반화 메트릭에서 찾을 수 있음을 신호펩티드의 절단위치 예측실험을 통하여 알아본다.
목차
요약
Abstract
1. 서론
2. SVM과 스트링 커널
3. 실수 지수를 가지는 메트릭
4. 실험 및 분석
5. 결론 및 향후연구
참고문헌
참고문헌 (22)
참고문헌 신청
1. [학술지(정기간행물)] - Jaakkola, T. / 2000 / A discriminative framework for detecting remote protein homologies / J. Comp. Biol. 7 : 95 ~ 114
2. [학술지(정기간행물)] - Pavlidis, P. / 2002 / Learning gene functional classifications from multiple data types / J. Comp. Biol. 9 : 401 ~ 411
3. [학술지(정기간행물)] - Hua, S. / 2001 / Support vector machine approach for protein subcellular localization prediction / Bioinformatics 17 : 721 ~ 728
4. [학술지(정기간행물)] - Zavaljevski, N. / 2002 / Support vector machines with selective kernel scaling for protein classification and identification of key amino acid positions / Bioinformatics 18 : 689 ~ 696
5. [학술대회논문] - Vert, J.P. / 2002 / Support vector machine prediction of signal peptide cleavage site using a new class of kernels for strings / proc. pacific symposium on biocomputing : 649 ~ 660
2. [학술지(정기간행물)] - Pavlidis, P. / 2002 / Learning gene functional classifications from multiple data types / J. Comp. Biol. 9 : 401 ~ 411
3. [학술지(정기간행물)] - Hua, S. / 2001 / Support vector machine approach for protein subcellular localization prediction / Bioinformatics 17 : 721 ~ 728
4. [학술지(정기간행물)] - Zavaljevski, N. / 2002 / Support vector machines with selective kernel scaling for protein classification and identification of key amino acid positions / Bioinformatics 18 : 689 ~ 696
5. [학술대회논문] - Vert, J.P. / 2002 / Support vector machine prediction of signal peptide cleavage site using a new class of kernels for strings / proc. pacific symposium on biocomputing : 649 ~ 660
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