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한국의 시화호와 중국의 Aha호 저질토에서 서식하는 황산염 환원세균(sulfate reducing bacteria, SRB)의 깊이에 따른 군집구조를 비교하기 위하여, 이화성 아황산염 환원효소(EC 1.8.99.1; dissimilatory sulfite reductase, dsr) 유전자를 대상으로, polymerase chain reaction (PCR), denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE) 및 클론 라이브러리를 이용하여 미생물의 군집구조를 분석하였다. DGGE band 양상을 분석한 결과, Aha호보다는 시화호에서 더 많은 밴드를 보여 다양성이 높았고, 깊이별 차이는 나타나지 않았다. 두 서식지에서 얻은 총 68개 클론의 염기서열을 가지고 계통학적 분석을 한 결과 시화호에서는 Deltaproteobacteria 그룹, Firmicutes 그룹에 속해있는 Desulfotomaculum 종과 archaeal thermophilic SRB 그룹에 속해있는 Archaeoglobus 종이, Aha호에서는 Desulfotomaculum 그룹과 유사성이 높았다. 분리된 대부분의 클론들(59%)은 배양된 황산염 환원세균과는 매우 낮은 유사도를 보였고, 환경에서 분리된 클론들과도 90% 이하의 유사도를 나타냈다. 총 클론을 88% 유사도를 기준으로 9그룹으로 나뉘었을 때 시하호와 Aha호의 각 클론은 서로 다른 그룹으로 존재하였다. 이러한 결과는 두 서식지의 이화성 아황산염 환원효소를 가지고 있는 미생물의 군집구조는 확연히 다르고 각 서식지에 특이적인 황산염 환원 미생물이 존재함을 시사한다.
목차
재료 및 방법
결과 및 고찰
감사의 말
참고문헌
ABSTRACT
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Kim In-Seon , 2007 , The Vertical Distribution of Sulfate Reducing Bacteria (SRB) by Florescence In Situ Hybridization in Sediments of Lakes in Korea and China , 한국하천호수학회지 40 (4) : 553 ~ 559
현문식 , 1999 , 시화호 저니(Sediment)에서의 유기물 및 중금속 농도와 혐기성 호흡세균과의 상관관계 , Kor. J. Appl. Microbiol. Biotechnol 3 : 252 ~ 259
Aron, L.M. , 1989 , Acid stress and aquatic microbial interactions , CRC Press : 1 ~ 19
Bahr, M. , 2005 , Molecular characterization of sulfate-reducing bacteria in a New England salt marsh. Environ , Microbiol 7 : 1175 ~ 1185
Barton, L.L , 1995 , Characteristics and activities of sulfate-reducing bacteria , Peplum Press : 1 ~ 32
현문식 , 1999 , 시화호 저니(Sediment)에서의 유기물 및 중금속 농도와 혐기성 호흡세균과의 상관관계 , Kor. J. Appl. Microbiol. Biotechnol 3 : 252 ~ 259
Aron, L.M. , 1989 , Acid stress and aquatic microbial interactions , CRC Press : 1 ~ 19
Bahr, M. , 2005 , Molecular characterization of sulfate-reducing bacteria in a New England salt marsh. Environ , Microbiol 7 : 1175 ~ 1185
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