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논문 기본 정보
- 자료유형
- 학술저널
- 저자정보
- 저널정보
- Korean Institute of Information Scientists and Engineers 정보과학회논문지 : 데이타베이스 정보과학회논문지 : 데이타베이스 제41권 제3호
- 발행연도
- 2014.6
- 수록면
- 162 - 167 (6page)
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마이크로어레이(microarray) 데이터 분석은 특정 세포에서 발현(expression)되는 수천 가지 유전자로부터 중요한 생물학적 정보를 추출하기 위해 널리 사용되고 있다. 그러나 발현된 유전자들 중 대부분은 실제 임상 진단 및 질병 분류와 무관하거나 중요하지 않은 경우가 많기 때문에 소수의 중요한 유전자들을 선별하는 방법이 요구되고 있다. 본 논문에서는 맵리듀스(MapReduce) 프로그래밍 모델을 이용하여 확장 가능한(scalable) 병렬 유전자 선택 기법을 제안한다. 제안하는 기법은 맵리듀스 기반으로 유전자 선별 작업을 병렬적으로 수행하고, 분류의 정확도를 평가하기 위해 kNN 분류 알고리즘을 활용한다. 또한 실험 결과를 통하여 제안 기법이 데이터 크기의 증가와 노드 개수의 차이에 따라 좋은 확장성(scalability)을 제공하고 있고, 선별한 유전자들을 사용한 분류 결과가 전체 유전자 집합을 사용한 분류보다 더 높은 분류 정확도를 가지고 있음을 보인다.
목차
요약
Abstract
1. 서론
2. 관련 연구
3. 병렬 유전자 선택 기법
4. 실험 결과
5. 결론
References
참고문헌 (14)
참고문헌 신청
1. [학술지(정기간행물)] - C. Austin / 2010 / Novel methods to identify biologically relevant genes for leukemia and prostate cancer from gene expression profiles / BMC Genomics 11 : 274 ~
2. [학술지(정기간행물)] - A. H. Chen / 2011 / A novel support vector sampling technique to improve classification accuracy and to identify key genes of leukaemia and prostate cancers / Expert Systems with Applications 38 (4) : 3209 ~ 3219
3. [학술지(정기간행물)] - J. Dean / 2008 / Mapreduce: simplified data processing on large clusters / Communications of the ACM 51 (1) : 107 ~ 113
4. [학술지(정기간행물)] - C. P. Lee / 2011 / A novel hybrid feature selection method for microarray data analysis / Applied Soft Computing 11 (1) : 208 ~ 213
5. [학술지(정기간행물)] - Y. Leu / 2010 / A gene selection method for microarray data based on sampling / Computational Collective Intelligence. Technologies and Applications : 2010 ~
2. [학술지(정기간행물)] - A. H. Chen / 2011 / A novel support vector sampling technique to improve classification accuracy and to identify key genes of leukaemia and prostate cancers / Expert Systems with Applications 38 (4) : 3209 ~ 3219
3. [학술지(정기간행물)] - J. Dean / 2008 / Mapreduce: simplified data processing on large clusters / Communications of the ACM 51 (1) : 107 ~ 113
4. [학술지(정기간행물)] - C. P. Lee / 2011 / A novel hybrid feature selection method for microarray data analysis / Applied Soft Computing 11 (1) : 208 ~ 213
5. [학술지(정기간행물)] - Y. Leu / 2010 / A gene selection method for microarray data based on sampling / Computational Collective Intelligence. Technologies and Applications : 2010 ~
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