열대 해양 해면 Cinachyrella sp.와 Plakortis sp.의 공생세균 군집의 계통학적 다양성

정종빈; 박진숙

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자료유형: 학술저널

저자정보: 정종빈 (한남대학교) 박진숙 (한남대학교)

저널정보: 한국미생물학회 미생물학회지 미생물학회지 51권 1호

발행연도: 2015.3

수록면: 31 - 38 (8page)

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2012년 2월 남태평양 미크로네시아 축(Chuuk)에서 채집한 두 종의 해양해면 Cinachyrella sp.와 Plakortis sp.의 공생세균의 군집구조를 PCR-DGGE 방법을 사용하여 조사하였다. Cinachyrella sp.와 Plakortis sp. 해면의 total genomic DNA에서 16S rRNA gene-V3 부분을 증폭하여 DGGE를 수행하였으며, 두 종의 해면에서 서로 다른 밴드 패턴이 나타났다. DGGE 밴드로부터 16S rRNA gene의 부분 염기서열을 분석한 결과, 알려진 균주의 염기서열들과 87-100%의 유사도를 나타내었다. Cinachyrella sp.의 공생세균 군집구조는 Actinobacteria, Bacteroidetes, Chloroflexi, 그리고 Proteobacteria (Alpha-, Gamma-, Delta-), 6강으로 구성되었다. Plakortis sp.의 공생세균 군집구조는 Actinobacteria, Chloroflexi, Firmicutes, Spirochaetes 그리고 Proteobacteria (Alpha-, Gamma-, Delta-), 7강으로 구성되었다. 두 종의 해면에서 Actinobacteria, Chloroflexi와 Proteobacteria가 공통적으로 존재하였으나 주요 세균군집은 서로 다른 것으로 나타났다. 즉 Cinachyrella sp.의 경우 Proteobacteria가, Plakortis sp.의 경우, Chloroflexi가 주요 세균 군집이었다. 동일지역에서 채집한 서로 다른 두 종의 해면은 각각 다른 공생세균 군집구조를 나타내어 해면 종에 따른 숙주 특이적 분포를 보이는 것으로 나타났다.

#Cinachyrella sp. #Plakortis sp. #bacterial community #PCR-DGGE #sponge

참고문헌 (30)

참고문헌 신청

Bauvais, C / 2015 / Sponging up metals: Bacteria associated with the marine sponge Spongia officinalis / Mar. Environ. Res 104:20~30

Brock, T. D / 1984 / Biology of microbiology / Prentice Hall

Brück, W. M / 2012 / The bacterial community of the lithistid sponge Discodermia spp. as determined by cultivation and culture-independent methods / Mar. Biotechnol 14:762~773

조현희 / 2010 / 해면 Spirastrella abata와 Cinachyrella sp.의 공생 세균의 계통학적 다양성 / 미생물학회지 46(2):177~182

Cottrell, M. T / 2000 / Natural assemblages of marine Proteobacteria and members of the Cytophaga-Flavobacter cluster consuming low- and high-molecular-weight dissolved organic matter / Appl. Environ. Microbiol 66:1692~1697

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