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저자정보
손호선 (충북대학교) 김경옥 (우송정보대학) 차은종 (충북대학교) 김경아 (충북대학교)
저널정보
대한전기학회 전기학회논문지 전기학회논문지 제65권 제7호
발행연도
2016.7
수록면
1,236 - 1,241 (6page)

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Cancer has been the most frequent in Korea, and pathogenesis and progression of cancer have been known to be occurred through various causes and stages. Recently, the research of chromosomal and genetic disorder and the research about prognostic factor to predict occurrence, recurrence and progress of chromosomal and genetic disorder have been performed actively. In this paper, we analyzed DNA methylation data downloaded from TCGA (The Cancer Genome Atlas), open database, to research bladder cancer which is the most frequent among urinary system cancers. Using three level of methylation data which had the most preprocessing, 59 candidate CpG island were extracted from 480,000 CpG island, and then we analyzed extracted CpG island applying data mining technique. As a result, cg12840719 CpG island were analyzed significant, and in Cox’s regression we can find the CpG island with high relative risk in comparison with other CpG island. Shown in the result of classification analysis, the CpG island which have high correlation with bladder cancer are cg03146993, cg07323648, cg12840719, cg14676825 and classification accuracy is about 76%. Also we found out that positive predictive value, the probability which predicts cancer in case of cancer was 72.4%. Through the verification of candidate CpG island from the result, we can utilize this method for diagnosing and treating cancer.
#Bladder cancer #TCGA(The Cancer Genome Atlas) #CpG island #ROC #Coxs regression

목차

Abstract
1. 서론
2. 모집단 및 연구방법
3. 실험결과
4. 고찰 및 결론
References

참고문헌 (12)

참고문헌 신청
[학술지(정기간행물)] - 정규원 / 2015 / Prediction of Cancer Incidence and Mortality in Korea, 2015 / Cancer Research and Treatment 47 (2) : 142 ~ 148 dbpia [인터넷자원] - J. K. Lee / / Genetic variation and diseases google schola [인터넷자원] - / / http://cancergenome.nih.gov/ google schola [기타자료] - Y. J. Kim / 2015 / Method for Diagnosis of Bladder Cancer using PRAC methylation and a use thereof / 10-2015-0026574 google schola [단행본] - J. Han / 2006 / Data Mining: Concepts and Techniques / The Morgan Kaufmann publishers google schola

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