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논문 기본 정보

자료유형
학술저널
저자정보
박민석 (Gachon University) 장기업 (Gachon University) 이태건 (Gachon University) 윤영미 (Gachon University)
저널정보
한국컴퓨터정보학회 한국컴퓨터정보학회논문지 한국컴퓨터정보학회 논문지 제22권 제3호(통권 제156호)
발행연도
2017.3
수록면
131 - 138 (8page)

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New drug development is time-consuming and costly. Hence, it is necessary to repurpose old drugs for finding new indication. We suggest the way that repurposing old drug using massive literature data and biological network. We supposed a disease-drug relationship can be available if signal pathways of the relationship include significant genes identified in literature data. This research is composed of three steps-identifying significant gene using co-occurrence in literature; analyzing the shortest path on biological network; and scoring a relationship with comparison between the significant genes and the shortest paths. Based on literatures, we identify significant genes based on the co-occurrence frequency between a gene and disease. With the network that include weight as possibility of interaction between genes, we use shortest paths on the network as signal pathways. We perform comparing genes that identified as significant gene and included on signal pathways, calculating the scores and then identifying the candidate drugs. With this processes, we show the drugs having new possibility of drug repurposing and the use of our method as the new method of drug repurposing.
#Systems biology #Network biology #Text mining #Drug repositioning

목차

Abstract
I. Introduction
II. Related works
III. The Proposed Scheme
IV. Result
V. Conclusion
REFERENCES

참고문헌 (20)

참고문헌 신청
[학술지(정기간행물)] - Oprea, T. I / 2012 / Drug repurposing: far beyond new targets for old drugs / The AAPPS journal 14 (4) : 759 ~ 763 google schola [학술지(정기간행물)] - Liu, Zhichao / 2013 / In silico drug repositioning–what we need to know / Drug discovery today 18 (3) : 110 ~ 115 google schola [학술지(정기간행물)] - Andronis, Christos / 2011 / Literature mining, ontologies and information visualization for drug repurposing / Briefings in bioinformatics 12 (4) : 357 ~ 368 google schola [학술지(정기간행물)] - 장기업 / 2016 / 유사 약물 예측을 위한 텍스트 마이닝 기반의 새로운 약물 유사도 측정 방법 / 한국정보기술학회논문지 14 (7) : 127 ~ 137 dbpia [학술지(정기간행물)] - Wu, Zikai / 2013 / Network-based drug repositioning / Molecular BioSystems 9 (6) : 1268 ~ 1281 google schola

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