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논문 기본 정보

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한국데이터정보과학회 한국데이터정보과학회지 한국데이터정보과학회지 제23권 제1호
발행연도
2012.2
수록면
39 - 51 (13page)

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군집분석은 마이크로어레이 발현자료에서 유전자 혹은 표본들의 유사한 특성을 갖는 연관구조를 조사하는데 중요한 도구이다. 본 논문에서는 마이크로어레이 자료에서 계층적 군집방법, K-평균법, PAM (partitioning around medoids), SOM (self-organizing maps) 그리고 모형기반 군집방법 들의 성능을 3가지 군집 타당성 측도인 내적 측도, 안정적 측도 그리고 생물학적 측도를 가지고 비교분석하고자 한다. 모의실험을 통해 생성된 자료와 실제 SRBCT (small round blue cell tumor) 자료를 가지고 여러 가지 군집방법들의 성능을 비교하였으며 그 결과 모의실험 자료에서는 거의 모든 방법들이 3가지 군집측도에서 원래 자료와 일치하는 좋은 군집 결과를 나타내었고 SRBCT 자료에서는 모의실험 자료처럼 명확한 군집화 결과를 보여주지는 않으나 내적측도의 실루엣 너비 (Silhouette width) 관점에서는 PAM 방법, SOM, 모형기반 군집방법 그리고 생물학적 측도에서는 PAM 방법과 모형기반 군집방법이 모의실험 결과와 비슷한 결과를 얻었고 안정적 측도에서 모형기반 군집방법이 다른 방법들보다 좋은 군집결과를 보여주었다.
#군집분석 #microarray #internal measure #Biological measure #cluster analysis #내적측도 #마이크로어레이 #생물학적 측도 #stability measure #안정적 측도

목차

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참고문헌 (23)

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1. [학술지(정기간행물)] - 김재희 / 2009 / 군집분석, 연결성, 실루엣, 한우 관능평가데이터, 군집분석 비교 및 한우 관능평가데이터 군집화 / 응용통계연구 22 (4) : 745 ~ 758 dbpia 2. [학술지(정기간행물)] - 여인권 / 2011 / 우리나라 기상자료에 대한 군집분석 / 한국데이터정보과학회지 22 (5) : 941 ~ 949 dbpia 3. [학술지(정기간행물)] - 이경아 / 2011 / 효모 마이크로어레이 유전자발현 데이터에 대한 군집화 비교 / 한국데이터정보과학회지 22 (4) : 741 ~ 753 dbpia 4. [학술지(정기간행물)] - 정윤경 / 2007 / 고차원(유전자 발현) 자료에 대한 군집 타당성분석 기법의 성능 비교 / 응용통계연구 20 (1) : 167 ~ 181 google schola 5. [학술지(정기간행물)] - 주용성 / 2009 / 한국 기상자료의 군집분석: 베이지안 모델기반 방법의 응용 / 한국데이터정보과학회지 20 (1) : 57 ~ 64 dbpia

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