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저자정보
김혜민 (부산대학교) 김정안 (부산대학교) 우효정 (부산대학교) 홍정현 (부산대학교) 김진엽 (부산대학교) 김희수 (부산대학교)
저널정보
한국생명과학회 생명과학회지 생명과학회지 제27권 제10호
발행연도
2017.10
수록면
1,215 - 1,224 (10page)

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현재까지 다양한 암의 발병 원인이 밝혀졌는데, 그 중 하나로써 DNA에 돌연변이가 축적되어 유전체가 불안정해짐에 따라 암이 발생될 수 있는 기작들이 주목받고 있다. 생물정보학과 유전체학의 발달에 따라 질병 연구에 있어서 보다 더 정확하고 신뢰성 있는 바이오마커를 찾는 것이 가능해졌다. 따라서, 생물정보학과 유전체학의 연구 기반을 바탕으로 한 암의 바이오마커는 암의 조기진단뿐만 아니라, 더 나아가 암 발생 예측과 암환자의 예후진단에 적용될 수 있다. 최근 들어 인간 유전체에서 약 45%를 차지하는 이동성 유전인자(transposable elements, TEs)가 유전자의 발현 조절과 DNA의 돌연변이를 유도함으로써 다양한 질병에 영향을 미친다는 사실이 밝혀짐에 따라, 이러한 이동성 유전인자들이 암의 발생과 어떤 연관이 있는지에 대한 연구 또한 활발히 진행되고 있다. 따라서 우리는 이동성 유전인자가 대장암과 어떤 연관성이 있는지에 대해 조사를 하였으며, 이를 어떻게 바이오마커로 활용할 수 있는지 알아보았다. 우선, 이동성 유전인자 중 인간 유전체에 많이 존재하면서 유전체에 많은 영향을 미치는 LINE-1 (long interspersed nuclear element-1, L1)과 Alu, LTR (long terminal repeat) 위주로 확인하였다. 흥미롭게도, 대장암 세포에서 LINE-1의 저메틸화, APC 유전자 내에 LINE-1 삽입, Alu의 저메틸화와 과메틸화, LTR 삽입에 따른 isoform 발생 등이 특징적으로 나타나는 것을 알 수 있었다. 또한 원발암유전자에서의 L1 저메틸화가 대장암 전이의 바이오마커로 쓰일 수 있다는 것과 Alu에 의한 MLH1 돌연변이가 가족성 및 유전성 대장암에서 흔히 발견된다는 것을 알 수 있었다. 이 때 이동성 유전인자에 의하여 영향 받는 유전자들의 발현을 in silico 발현 분석을 통하여 분석하였으며, 조직별, 성별 특이적 발현 양상을 제시하였다. 이들을 토대로 대장암 바이오마커를 개발하여 유전성 대장암의 예측 및 대장암 진단 또는 대장암 예후 예측을 통한 개인 맞춤형 치료에 활용할 수 있을 것으로 예상된다.
#Alu element #colon cancer #long interspersed nuclear element-1 #long terminal repeats #transposable elements

목차

서론
본론
결론
References
초록

참고문헌 (47)

참고문헌 신청
Batzer, M. A. and Deininger, P. L. 2002. Alu repeats and human genomic diversity. Nat. Rev. Genet. 3, 370-379. Boxus, M. and Willems, L. 2009. Mechanisms of HTLV-1 persistence and transformation. Br. J. Cancer 101, 1497-1501. Chenais, B. 2013. Transposable elements and human cancer: a causal relationship? Biochim. Biophys. Acta-Rev. Cancer 1835, 28-35. Chen, J. M., Stenson, P. D., Cooper, D. N. and Ferec, C. 2005. A systematic analysis of LINE-1 endonuclease-dependent retrotranspositional events causing human genetic disease. Hum. Genet. 117, 411-427. Cruickshanks, H. A., Vafadar-Isfahani, N., Dunican, D. S., Lee, A., Sproul, D., Lund, J. N., Meehan, R. R. and Tufarelli, C. 2013. Expression of a large LINE-1-driven antisense RNA is linked to epigenetic silencing of the metastasis suppressor gene TFPI-2 in cancer. Nucleic Acids Res. 41, 6857-6869.

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