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저널정보
한국자기공명학회 Journal of the Korean Magnetic Resonance Society Journal of the Korean Magnetic Resonance Society 제14권 제1호
발행연도
2010.1
수록면
45 - 54 (10page)

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HP1423 (Y1423_HELPY) is a conserved hypothetical protein from H. pylori strain 26695. However, Sequence Blast result indicates that HP1423 belongs to S4 (PF01479) superfamily. According to Pfam database, the S4 domain is a small domain consisting of 60-65 amino acid residues, that probably mediates binding to RNA. In this study, we report the sequence-specific backbone resonance assignment of HP1423, which has 84 amino acid residues. We could assign unambiguously about 88% of all 1HN, 15N, 13Cα, 13Cβ and 13C=O resonances. We could not detect the resonances from residues 15-20, and disappearance of these peaks seems to be related with the intermediate-conformational exchange. These assigned NMR peaks of HP1423 can be used for studying the role of protein dynamics in millisecond timescale, and Protein-RNA binding.
#Helicobacter pylori #NMR #HP1423 #Backbone assignment #Secondary structure

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