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논문 기본 정보
- 자료유형
- 학술저널
- 저자정보
- 저널정보
- 한국자료분석학회 Journal of The Korean Data Analysis Society Journal of The Korean Data Analysis Society 제16권 제5호
- 발행연도
- 2014.1
- 수록면
- 2,417 - 2,425 (9page)
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DNA 바코드는 분류학 분야의 새로운 도구로 제안되었으나, DNA 바코드의 유효성은 여전히 경험적으로 평가될 필요성이 있다. DNA 바코드를 이용한 생물종의 동정은 미토콘드리아 COI(cytochrome c oxidase I) 유전자를 대상으로 추출된 DNA 염기서열들 간 거리의 계산과 비교를 통해 이루어진다. 이 때 연구대상의 특정 분류군들마다 종을 동정하는데 사용할 수 있는 DNA 바코드 거리간의 임계값이 존재하며, 이를 이용하여 오동정(misidentification)의 가능성을 줄일 수 있다. 본 논문에서는 생물다양성의 평가에서 반드시 필요한 정확한 종의 동정을 위한 종의 경계를 설정하기 위하여 DNA 바코드 염기서열간 거리의 임계값(threshold)에 대해 논의하였다. 즉, 동정이 불안정한 것으로 간주되거나 동정이 어려운 경우 DNA 바코드들 간의 Kimura 2-모수 거리를 이용하여 오동정의 확률을 줄이기 위한 임계값 선택법을 제안하고, 이를 8종 24개체의 Neosiphonia와 3종 12개체의 Polysiphonia 바코드 자료에 적용하여 Kimura 2-모수 거리의 임계값 선택에 의한 분류가 효율적임을 확인하였다.
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참고문헌 (26)
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Zhi, L. / 1996 / Genomic differentiation among natural populations of orang-utan(Pongo pygmaeus) / Current Biology 6:1326~1336
Bergmann, T. / 2013 / The potential of distance-based thresholds and character-based DNA barcoding for defining problematic taxonomic entities by CO1 and ND1 / Molecular Ecol
Bond, J. E. / 2003 / Molecular taxonomy of the Anadenobolus excisus(Diplopoda : Spirobolida : Rhinocricidae)species-group on the Caribbean island of Jamaica / Invertebrate Sy
Bond, J. E. / 2004 / Systematics of the Californian euctenizine spider genus Apomastus(Araneae : Mygalomorphae : Cyrtaucheniidae) : The relationship between molecular and mor
Chu, K. H. / 1999 / Mitochondrial cytochrome oxidase I sequence divergence in some Chinese species of Charybdis(Crustacea : Decapoda : Portunidae) / Biochemical Systematics a
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