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논문 기본 정보

자료유형
학술저널
저자정보
저널정보
한국미생물생명공학회 Journal of Microbiology and Biotechnology Journal of Microbiology and Biotechnology 제18권 제7호
발행연도
2008.1
수록면
1,203 - 1,206 (4page)

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A Gram-positive strain designated as MSL-14T isolated from a soil sample collected from Bigeum Island, Korea, was subjected to polyphasic taxonomy. The isolate was strictly aerobic. Cells were short rods and motile. Optimum growth temperature and pH was 28oC and 7.0, respectively. It was characterized chemotaxonomically as having a cell-wall peptidoglycan type based on LL-2,6-diaminopimelic acid and MK-8(H4) as the predominant menaquinone. The major fatty acids were iso-C16:0, C17:1 omega8c, and C18:1 omega9c. The G+C content was 67.6 mol%. Phylogenetic analysis based on the 16S rRNA gene sequence revealed that strain MSL-14T is affiliated to the genus Nocardioides and formed a distinct lineage within the genus. MSL-14T showed highest sequence similarity to Nocardioides aestuarii JCM 12125T, having a similarity of 96.5%. Based on the 16S rRNA gene sequence divergence and phenotypic characteristics, it is proposed that strain MSL-14T should be classified as representing a novel member of the genus Nocardioides, for which we propose the name Nocardioides tritolerans sp. nov. The type strain is strain MSL-14T (=KCTC 19289T= DSM 19320T).
#Nocardioides tritolerans sp. nov. #polyphasic taxonomy #16S rDNA

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Bakermans, C. / 2002 / Diversity of 16S rDNA and naphthalene dioxygenase genes from coal-tarwaste- contaminated aquifer waters. Microb / Ecol 44 : 95 ~ 106 google schola Chun, J. / 2007 / EzTaxon: A Web-based tool for the identification of prokaryotes based on 16S ribosomal RNA gene sequence. Int. J. Syst. Evol / Microbiol 57 : 2259 ~ 2261 google schola Felsenstein, J. / 1981 / Evolutionary tree from DNA sequences: A maximum likelihood approach. J. Mol / Evol 17 : 368 ~ 376 google schola Felsenstein, J. / 1985 / Confidence limits on phylogenetics: An approach using the bootstrap / Evolution 39 : 783 ~ 791 google schola Felsenstein, J. / 2002 / PHYLIP / University of Washington google schola

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