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논문 기본 정보

자료유형
학술저널
저자정보
저널정보
한국자료분석학회 Journal of The Korean Data Analysis Society Journal of The Korean Data Analysis Society 제21권 제2호
발행연도
2019.1
수록면
651 - 659 (9page)

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최근 의학을 비롯한 여러 분야에서 마이크로바이옴이 인체에 미치는 영향력을 분석하는 연구가 활발하게 진행 중에 있다. 마이크로바이옴은 인체에 공존하고 있는 장내 미생물의 유전체 정보를 총칭하는 용어로, 일반적으로 염기서열 배열에 관한 유전체 정보보다 풍부한 정보를 가지고 있다. 특히, 외부 환경적 요인 등의 정보도 포함하고 있는 것으로 알려져 있어 질병과 같은 반응변수와의 연관성 분석에 활용되고 있다. 마이크로바이옴의 발현 자료는 장내 미생물의 개체수로 측정되어 얻어지며, 크게 두 가지 특징을 가지고 있다. 첫째, 표본 관측치별로 장내의 환경이 다양한 관계로 각 미생물의 개체수는 척도에서 상당한 차이를 보인다. 하나의 대안으로 전체 미생물의 발현량 총합대비 각 미생물의 발현량의 비율을 분석에 활용할 수 있다. 둘째, 변수역할을 하는 미생물은 생물종분류에 따른 7단계의 위계적으로 분류된 군집정보를 가지고 있다. 본 연구에서는 비율의 합이 1로 제한된 심플렉스 제약식을 모형에 반영하는 방법을 설명하고, 종분류 그룹정보를 활용하는 분류방법을 소개하고자 한다. 혈류감염 유무와 관련된 마이크로바이옴 실제 발현 자료를 통해 방법의 특징을 살펴보고 그 유용성을 모색한다.
#compositional ratio #constraint #taxonomy #classification.

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참고문헌 (18)

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