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저자정보
Marc Ndimukaga (Jeonbuk National University) Kyunghye Won (Jeonbuk National University) Truong Anh Duc (National Institute of Veterinary Research) Ki-Duk Song (Jeonbuk National University)
저널정보
한국가금학회 한국가금학회지 한국가금학회지 제47권 제1호
발행연도
2020.3
수록면
9 - 19 (11page)

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본 연구는 고병원성 조류 인플루엔자 바이러스(high pathogenic avian influenza virus; HPAIV)와 저병원성 조류인플루엔자 바이러스(low pathogenic avian virus; LPAIV)가 감염된 오리의 폐세포에서 보고된 기존 전사체 데이터를 재분석하여 조류 인플루엔자 감염에 대응하는 숙주의 공통 전사체를 발굴하고, 생물정보 분석을 실시하여 바이오 마커로서 가능성을 제시하기 위하여 수행하였다. 이전 연구에서 생산된 microarray 데이터 세트를 재분석하여, HPAIV와 LPAIV가 각각 감염된 오리의 폐세포에서 각각 총 731 및 439개의 차등발현 유전자를 발굴하였다. 이들 차등발현 유전자 중에서, 227개의 유전자가 HPAIV와 LPAIV가 감염된 세포에서 공통적으로 조절되어, 193개의 유전자는 발현이 증가한 반면, 34개의 유전자는 발현이 감소하였다. 생물정보 분석을 통하여 차등발현 유전자들의 기능에 대한 주석달기를 실시하여, 리보솜과 단백질 대사 및 유전자 발현 관련 GO가 풍부해짐을 확인하였다. REACTOME 분석을 통하여 단백질 및 RNA 대사 경로 및 콜라겐 생합성과 변형을 포함한 조직 복구 경로가 조절됨을 확인하였다. 보다 구체적으로, 번역 및 RNA 품질 관리 경로에 관여하는 단백질을 코딩하는 유전자는 HPAIV 및 LPAIV 감염에 반응하여 발현의 증가 또는 감소하는 방향으로 조절되어 AIV가 숙주 번역 기계를 억제함으로써 숙주 방어 시스템을 회피할 수 있거나 번역을 위해 세포질로 내보내기 전에 AIV가 억제될 수 있음을 시사한다. AIV 감염은 바이러스 감염으로 인한 조직의 병변형성을 조절하는 경로를 활성화시킬 수 있음을 시사한다.
#avian influenza virus #ducks #differentially expressed genes #transcriptomic response #조류 인플루엔자 바이러스 #오리 #차등발현 유전자 #전사체 반응

목차

ABSTRACT
INTRODUCTION
MATERIALS AND METHODS
RESULTS
DISCUSSIONS
CONCLUSION
적요
REFERENCES

참고문헌 (36)

참고문헌 신청
Blasco-Moreno B / 2019 / The exonuclease Xrn1 activates transcription and translation of mRNAs encoding membrane proteins / Nature Commun 10(1):1298 google schola Byrd-Leotis L / 2017 / The interplay between the host receptor and influenza virus hemagglutinin and neuraminidase / Int J Mol Sci 18(7):1541 google schola Crowley TM / 2009 / Application of chicken microarrays for gene expression analysis in other avian species / BMC Genomics 10(Supple 2):S3 google schola Dou D / 2018 / Influenza A virus cell entry, replication, virion assembly and movement / Front Immunol 9:1581 google schola Evseev D / 2019 / Innate immune responses to avian influenza viruses in ducks and chickens / Vet Sci 6(1):5 google schola

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