Phylogenomics and its Growing Impact on Algal Phylogeny and Evolution

윤환수

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자료유형: 학술저널

저자정보: 윤환수 (University of Iowa, Department of Biological Sciences and the Roy J. Carver Center for Comparative Genomics)

저널정보: 한국조류학회(藻類) Algae Algae 제21권 제1호

발행연도: 2006.1

수록면: 1 - 10 (10page)

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Genomic data is accumulating in public database at an unprecedented rate. Although presently dominated by the sequences of metazoan, plant, parasitic, and picoeukaryotic taxa, both expressed sequence tag (EST) and complete genomes of free-living algae are also slowly appearing. This wealth of information offers the opportunity to clarify many long-standing issues in algal and plant evolution such as the contribution of the plastid endosymbiont to nuclear genome evolution using the tools of comparative genomics and multi-gene phylogenetics. A particularly powerful approach for the automated analysis of genome data from multiple taxa is termed phylogenomics. Phylogenomics is the convergence of genomics science (the study of the function and structure of genes and genomes) and molecular phylogenetics (the study of the hierarchical evolutionary relationships among organisms, their genes and genomes). The use of phylogenetics to drive comparative genome analyses has facilitated the reconstruction of the evolutionary history of genes, gene families, and organisms. Here we survey the available genome data, introduce phylogenomic pipelines, and review some initial results of phylogenomic analyses of algal genome data.

#algal evolution #endosymbiosis #genome database #genomics #phylogenomics

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