국내 식물검역대상 Phytophthora pinifolia의 PCR 검출을 위한 종 특이적 마커 개발

김나래; 최유리; 서문원; 송정영; 김홍기

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자료유형: 학술저널

저자정보: 김나래 (충남대학교 농업생명과학대학 응용생물학과) 최유리 (충남대학교 농업생명과학대학 응용생물학과) 서문원 (충남대학교 농업생명과학대학 응용생물학과) 송정영 (충남대학교 농업생명과학대학 응용생물학과) 김홍기 (충남대학교 농업생명과학대학 응용생물학과)

저널정보: 한국균학회 한국균학회지 한국균학회지 제44권 제2호

발행연도: 2016.1

수록면: 103 - 107 (5page)

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본 연구는 국내 주요 식물검역관리 대상 Phytophthora pinifolia를 대상으로 신속하고 정확한 병원균 종동정 및 검출을 위해 Ypt1 유전자 염기서열을 활용하여 제작된 종 특이적 분석용 분자마커와 다양한 PCR 기법을 활용하여 병원균들에 대한 다양한 검출기술의 표준화 및 최적 검출 시스템 구축을 통하여 실제 검역검역 현장에서 활용 가능한 병원균 존재여부의 신속, 정확한 판별기법을 개발하고자 수행하였다. Ypt1 영역의 염기서열을 기초로 선발된 종 특이적 primer는 1~10 pg의 검출민감도를 가지며 193 bp의 종 특이적 PCR 증폭산물을 형성시켰다. 또한 선발된 종 특이적 primer의 종 특이성을 확인하기 위하여 국내 식물검역대상에 포함된 Phytophthora속 종들과 주요 식물병원균들을 대상으로 conventional PCR과 real-time PCR을 수행한 결과 목표로 한 P. pinifolia DNA에서만 특이적 PCR 증폭산물을 확인할 수 있었다. 선발된 종 특이적 primer에 대한 PCR의 검출 민감도를 확인했을 때 conventional PCR의 검출민감도는 1~10 pg이었다.

#Detection #Phytophthora pinifolia #Quarantine measure #Species-specific primers

참고문헌 (14)

참고문헌 신청

The Korean Society of Plant Pathology / 2009 / List of plant diseases in Korea / Korean Society of Plant Pathology

Durán A / 2008 / Phytophthora pinifolia sp. nov. associated with a serious needle disease of Pinus radiata in Chile / Plant Pathol 57:715~727

Cooke DE / 2000 / A molecular phylogeny of Phytophthora and related Oomycetes / Fungal Genet Biol 30:17~32

Martin FN / 2003 / Phylogenetic relationships among phytophthora species inferred from sequence analysis of mitochondrially encoded cytochrome oxidase I and II genes / Mycologia 95:269~284

Wattier RA / 2003 / Sequence variation of intergenic mitochondrial DNA spacers (mtDNA-IGS) of Phytophthora infestans (Oomycetes) and related species / Mol Ecol Notes 3:136~138

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