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학술저널
저자정보
박보경 (경상남도농업기술원) 하병석 (경상남도농업기술원) 김민근 (경상남도농업기술원) 이병주 (충북농업기술원) 최종인 (경기도농업기술원) 류재산 (경상남도농업기술원)
저널정보
한국버섯학회 한국버섯학회지 한국버섯학회지 제14권 제4호
발행연도
2016.1
수록면
174 - 178 (5page)

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SSR은 병렬적으로 반복되는 작은 DNA서열을 말하며, 다양한 마커 기반 연구에 활용되고 있다. 국내의 주요 느타리품종인 '흑타리'와 '미소'의 유전체를 Pacbio를 이용하여 해독하였고 이 서열 정보에서 생물정보학을 이용하여 SSR을 분리하여 특성구명을 하였다. '흑타리'와 '미소' 유래 단핵균사의 유전체의 크기는 각각 40.8 Mbp와 40.3 Mbp로 밝혀졌고, 이는 사철느타리의 단핵균사 PC9과 PC15보다 컸으나, 큰느타리보다는 작았다. 총 949개와 968개의 SSR이 '흑타리'와 '미소'의 유전체 분석을 통하여 각각 검출되었다. 5개의 느타리류 유전체의 SSR 분포와 특징을 비교분석한 결과 흑타리와 미소의 SSR 갯수가 가장 많았으며, 이들의 반복서열의 분포는 다른 느타리류와 비슷한 경향을 보였다. 3-mers, 6-mers와 8-mers가 가장 발견빈도가 높은 패턴이었다.
#Simple sequence repeat #Pleurotus ostreatus #Mushroom #Molecular marker

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