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자료유형
학술저널
저자정보
Kumar, Satish (Bioinformatics Centre and Biochemistry, Mahatma Gandhi Institute of Medical Sciences) Jena, Lingaraja (Bioinformatics Centre and Biochemistry, Mahatma Gandhi Institute of Medical Sciences) Daf, Sangeeta (Datta Meghe Institute of Medical Sciences [Deemed University]) Mohod, Kanchan (Bioinformatics Centre and Biochemistry, Mahatma Gandhi Institute of Medical Sciences) Goyal, Peyush (Department of Biotechnology, Ministry of Science and Technology) Varma, Ashok K. (Advanced Centre for Treatment, Research and Education in Cancer)
저널정보
한국유전체학회 Genomics & informatics Genomics & informatics 제11권 제4호
발행연도
2013.1
수록면
289 - 291 (3page)

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Human papillomavirus (HPV) infection is the leading cause of cancer mortality among women worldwide. The molecular understanding of HPV proteins has significant connotation for understanding their intrusion in the host and designing novel protein vaccines and anti-viral agents, etc. Genomic, proteomic, structural, and disease-related information on HPV is available on the web; yet, with trivial annotations and more so, it is not well customized for data analysis, host-pathogen interaction, strain-disease association, drug designing, and sequence analysis, etc. We attempted to design an online reserve with comprehensive information on HPV for the end users desiring the same. The Human Papillomavirus Proteome Database (hpvPDB) domiciles proteomic and genomic information on 150 HPV strains sequenced to date. Simultaneous easy expandability and retrieval of the strain-specific data, with a provision for sequence analysis and exploration potential of predicted structures, and easy access for curation and annotation through a range of search options at one platform are a few of its important features. Affluent information in this reserve could be of help for researchers involved in structural virology, cancer research, drug discovery, and vaccine design.
#comparative modeling #DNA probes #genome #HPV #neoplasms #proteome

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Tungteakkhun SS / 2008 / The interaction between human papillomavirus type 16 and FADD is mediated by a novel E6 binding domain / J Virol 82:9600~9614 google schola Watts KJ / 2001 / Variable oncogene promoter activity of human papillomavirus type 16 cervical cancer isolates from Australia / J Clin Microbiol 39:2009~2014 google schola Zheng ZM / 2006 / Papillomavirus genome structure, expression, and post-transcriptional regulation / Front Biosci 11:2286~2302 google schola Gasteiger E / 2005 / The Proteomics Protocols Handbook / Humana Press :571~607 google schola Eswar N / 2007 / Comparative protein structure modeling using MODELLER / Curr Protoc Protein Sci (Chapter 2) google schola

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