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Hoa THI LE (Ulsan National Institute of Science and Technology (UNIST)) Assiya TAIZHANOVA (Kyung Hee University) Ye GAO (University of California) Linh KHANH NONG (Ulsan National Institute of Science and Technology (UNIST)) Joon Young PARK (Ulsan National Institute of Science and Technology (UNIST)) Eun-Jin LE (Korea University) Bernhard O. PALSSON (University of California San Diego) Donghyuk KIM (Ulsan National Institute of Science and Technology (UNIST))
저널정보
한국생물공학회 한국생물공학회 학술대회 2021 한국생물공학회 춘계학술발표대회 및 국제심포지엄 [초록집]
발행연도
2021.4
수록면
300 - 300 (1page)

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Promoter is a fundamental DNA sequence, where general transcription factors and the polymerase assemble, plays as an “on” switch initiate transcription of a single RNA. Especially, in pathogen bacteria, understanding the active promoter is required for expressing pathogenicity-related genes. Salmonella enterica serovar Typhimurium (S. Typhimurium) is a common foodborne pathogen. Despite being frequently used as the reference strain for Salmonella, genome-wide DNA regulatory elements in Salmonella remain unclear. In this study, we investigated a combined experimental and computational analysis for evaluating the regions in near single base-pair resolution where transcriptional regulatory elements bind to promoter under the basic condition without any stresses. In other words, we reconstructed the fundamental of genome-wide transcription factors and their correlation. At the same time, we expanded our search to sRNA which is a potential regulatory role on mRNA targets. For the representative strain S. Typhimurium strai ... 전체 초록 보기

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