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이예린 (농촌진흥청) 한지원 (농촌진흥청) 한고은 (농촌진흥청) 이은수 (농촌진흥청) 김도선 (농촌진흥청) 이혜은 (농촌진흥청)
저널정보
한국원예학회 한국원예학회 학술발표요지 원예과학기술지 제39권 별호Ⅱ [초록집]
발행연도
2021.10
수록면
209 - 209 (1page)

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양파(Allium cepa L.)는 조미채소로서 전 세계적으로 건강식품, 의약품 등으로 이용되고 있는 중요한 채소 중 하나이다. 국내 주요 재배 양파 품종은 대부분 중만생종이며, 본 실험에서는 중만생종 양파 품종 판별을 위한 SNP 마커세트를 개발하고자 하였다. 30개의 양파 핵심계통의 전사체 시퀀싱 정보를 활용하여 draft reference genome에 정렬한 후 총 1,515,410개의 SNP를 탐색하였다. 이중에서 대립유전자가 2개인 bi-alleic 형태의 SNP를 선발하였으며, missing data를 제거한 후 여러 단계의 필터링을 거쳐 PIC value값이 0.3 이상인 SNP 26,160개를 선발하였다. 선발된 SNP는 SNP 위치에서 up/down stream 방향으로 각가 500bp ... 전체 초록 보기

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