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자료유형
학술저널
저자정보
Qiang He (공주대학교) 정명일 (농촌진흥청) 김정수 (농촌진흥청)
저널정보
한국유전학회 Genes & Genomics Genes & Genomics Vol.41 No.9
발행연도
2019.1
수록면
1,085 - 1,093 (9page)

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Background At least eight structurally related forms of vitamin E occur in nature, four tocopherols and four tocotrienols, all of which are potent membrane-soluble antioxidants. In this study, we detected two major isoforms in sesame (Sesamum indicum L.) seed: γ-tocopherol and β-tocotrienol. The objective of this study is to investigate the genetic basis of these vitamin E isoforms. Methods We conducted a genome-wide association study (GWAS) using 5962 genome-wide markers, acquired from 96 core sesame accessions. The GWAS was performed using generalized linear (GLM) and mixed linear (MLM) models. Results LG08_6621957, on chromosome 8, was detected as having a significant association with γ-tocopherol in both models. It explained 20.9% of γ-tocopherol variation in sesame. For β-tocotrienol, no significant loci were detected according to the two models, but one locus, SLG03_13104062, explained 17.8% of the phenotypic variation. Based on structure and phylogenetic studies, the 96 accessions were clearly clustered into two subpopulations. Conclusion This study on sesame demonstrates and provides an evidence that genotyping by sequencing (GBS) based GWAS can be used to identifying important loci for small growing crops. The significant SNPs or genes could be useful for improving the vitamin E content in sesame breeding programs.
#Genotyping by sequencing · Genome-wide association study · Sesame · Vitamin E

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