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미생물 종 동정을 위한 분자학적 방법으로는 16S ribosomal RNA (rRNA) 유전자의 염기서열 분석이 대표적으로 이용된다 . 본 연구에서는 16S rRNA 유전자의 초가변영역 중 V1-V3 영역의 염기서열 분석을 통하여 종 (species) 을 동정하는 상용화된 미생물 종 동정 키트인 Fast MicroSEQ TM 500 16S rDNA Bacterial Identification System 의 사용으로 인해 빈번히 발생하는 종 동정의 어려움을 개선하고자 하였다 . 이를 위해 분석하는 염기서열의 길이를 V1-V4 영역으로 확장하고 , EzBioCloud 16S-based ID 를 데이터베 이스로 추가 활용하여 미생물 종 동정능이 향상된 사례를 소개하고자 한다 .
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NM Green / 2010 / The clinical microbiologist’s molecular tool box : an everexpanding resource for bacterial identification in the laboratory / Clinic Microbiol Newsletter 32(20):151~159
고관수 / 2008 / 미동정 균주의 염기서열 분석을 이용한 동정, 워크샵: 감염질환의 분자생물학적 진단 / Infect Chemo 40(2):S121~S124
B Yang / 2016 / Sensitivity and correlation of hypervariable regions in 16S rRNA genes in phylogenetic analysis / BMC Bioinformatics 17:1~8
L Cai / 2013 / Biased Diversity Metrics Revealed by Bacterial 16S Pyrotags Derived from Different Primer Sets / PLOS ONE 8(1):e53649
F Guo / 2013 / Taxonomic Precision of Different Hypervariable Regions of 16S rRNA Gene and Annotation Methods for Functional Bacterial Groups in Biological Wastewater Treatment / PLOS ONE 8(10):e76185
고관수 / 2008 / 미동정 균주의 염기서열 분석을 이용한 동정, 워크샵: 감염질환의 분자생물학적 진단 / Infect Chemo 40(2):S121~S124
B Yang / 2016 / Sensitivity and correlation of hypervariable regions in 16S rRNA genes in phylogenetic analysis / BMC Bioinformatics 17:1~8
L Cai / 2013 / Biased Diversity Metrics Revealed by Bacterial 16S Pyrotags Derived from Different Primer Sets / PLOS ONE 8(1):e53649
F Guo / 2013 / Taxonomic Precision of Different Hypervariable Regions of 16S rRNA Gene and Annotation Methods for Functional Bacterial Groups in Biological Wastewater Treatment / PLOS ONE 8(10):e76185
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