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저자정보
성지희 (서울대학교) 김나영 (서울대학교) 김재연 (서울대학교) 조현진 (서울대학교) 박지현 (서울대학교) 남령희 (서울대학교) 석영재 (서울대학교) 김연란 (서울대학교 미생물연구소) 이동호 (서울대학교) 정현채 (서울대학교)
저널정보
대한암예방학회 대한암예방학회지 대한암예방학회지 제21권 제1호
발행연도
2016.1
수록면
60 - 65 (6page)

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Background: Not much is known about the role of gastric microbiota except for Helicobacter pylori in human health and disease. In this study, we aimed to detect human gastric microbiota in both gastric mucosa and gastric juice by barcoded 454-pyrosequencing of the 16S rRNA gene and to compare the results from mucosa and juice. Methods: Gastric biopsies and stomach juices were collected from 4 subjects who underwent standard endoscopy at Seoul National University Bundang Hospital. Gastric microbiota of antral mucosa, corpus mucosa samples, and gastric fluids were analyzed by barcoded 454-pyrosequencing of the 16S rRNA gene. The analysis focused on bacteria, such as H. pylori and nitrosating or nitrate-reducing bacteria. Results: Gastric fluid samples showed higher diversity compared to that of gastric mucosa samples. The mean of operational taxonomic units was higher in gastric fluid than in gastric mucosa. The samples of gastric fluid and gastric mucosa showed different composition of phyla. The composition of H. pylori and Proteobacteria was higher in mucosa samples compared to gastric fluid samples (H. pylori, 66.5% vs. 3.3%, P = 0.033; Proteobacteria, 75.4% vs. 26.3%, P = 0.041), while Actinobacteria, Bacteroidetes, and Firmicutes were proportioned relatively less in mucosa samples than gastric fluid. However there was no significant difference. (Actinobacteria, 3.5% vs. 20.2%, P = 0.312; Bacteroidetes, 6.0% vs. 14.8%, P = 0.329; Firmicutes, 12.8% vs. 33.4%, P = 0.246). Conclusions: Even though these samples were small, gastric mucosa could be more effective than gastric fluid in the detection of meaningful gastric microbiota by pyrosequencing.

목차

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참고문헌 (26)

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Delgado S / 2013 / Microbiological survey of the human gastric ecosystem using culturing and pyrosequencing methods / Microb Ecol 65:763~772 google schola Rakoff-Nahoum S / 2004 / Recognition of commensal microflora by toll-like receptors is required for intestinal homeostasis / Cell 118:229~241 google schola Mazmanian SK / 2005 / An immunomodulatory molecule of symbiotic bacteria directs maturation of the host immune system / Cell 122:107~118 google schola Hattori M / 2009 / The human intestinal microbiome: a new frontier of human biology / DNA Res 16:1~12 google schola Bik EM / 2006 / Molecular analysis of the bacterial microbiota in the human stomach / Proc Natl Acad Sci U S A 103:732~737 google schola

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