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박성준 (한국과학기술연구원) 문주희 (한국과학기술연구원) 양원숙 (한국과학기술연구원) Mohammad Humayun Kabir (BRI Korea Institute of Science and Technology) 엄정훈 (한국과학기술연구원) 신지혜 (한국과학기술연구원) 안희성 (한국과학기술연구원) 주신영 (한국과학기술연구원) 권유미 (한국과학기술연구원) 김미정 (한국과학기술연구원) 전동휘 (한국과학기술연구원) 이수민 (한국과학기술연구원) 박예은 (한국과학기술연구원) 김경연 (한국과학기술연구원) 이지은 (한국과학기술연구원) 양은경 (한국과학기술연구원) 유명희 (한국과학기술연구원) 노동영 (서울대학교) 이철주 (한국과학기술연구원)
저널정보
한국구조생물학회 Biodesign Biodesign 제3권 제1호
발행연도
2015.3
수록면
48 - 54 (7page)

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Breast cancer is the most common cancer among women worldwide. There is an emerging interest in protein expressionprofiling with the aim of identifying novel diagnostic markers and therapeutic targets in breast cancer. We analyzed breastcancer tissues by using the cICAT (cleavable isotope-coded affinity tag) labeling approach and tandem mass spectrometry. Breast cancer and matched normal tissues were fractionated by ultracentrifugation to enrich membrane proteins, andcICAT labeled proteins were separated by SDS-PAGE. A total of 364 proteins were identified and quantified. Among theproteins that showed >1.5 fold difference between normal and cancer (36.6%), five (RPN1, ERp29, Trop2, PrP and PIGR)were selected for confirmation. Western blot on 10 pairs of normal and cancer tissues revealed that the expression ofRPN1 and ERp29 were increased in breast cancer tissue, while Trop2, PrP and PIGR were decreased. Those Western blotresults were highly consistent with cICAT results. Higher level of RPN1 and ERp29 and lower level of Trop2 in breast cancercell lines compared to normal breast cell lines were observed. The result supports reliability of our SDS-PAGE based ICATmethod in quantifying cancer tissue proteome.

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