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논문 기본 정보
- 자료유형
- 학위논문
- 저자정보
- 지도교수
- 羅晟洙
- 발행연도
- 2013
- 저작권
- 고려대학교 논문은 저작권에 의해 보호받습니다.
이용수0
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본 연구에서는 단백질의 연구를 위하여 최근 모사시험의 기법 중 등장한 진동 모드 축소기법을 통하여 새로운 알고리즘을 제시하여 구조 변화 연구에 기여한다. 단백질의 구조 변화 연구에서는 전체적인 움직임을 고려하며 이에 기반이 되는 탄소 원자 중에서도 Cα만을 고려하여 보다 간단한 모델을 통해 진행하였다. 또한 여기에 정규모드해석 방법 중 최근 단백질을 연구함에 있어서 적용된 모드축소기법을 형태 변화 연구에 새롭게 적용하여 모드해석을 수행할 때에 축소된 모드를 통하여 해석함으로써 보다 적은 모드를 이용하여도 기존과 유사한 결과가 나옴을 언급하고자 한다. 이를 실제와 유사한 구조 변화로 진행하기 위하여 에너지 안정화를 Go-model을 이용하기로 한다. 본 연구에서는 단백질의 연구를 위하여 최근 모사시험의 기법 중 등장한 진동 모드 축소기법을 통하여 새로운 알고리즘을 제시하여 구조 변화 연구에 기여한다. 단백질의 구조 변화 연구에서는 전체적인 움직임을 고려하며 이에 기반이 되는 탄소 원자 중에서도 Cα만을 고려하여 보다 간단한 모델을 통해 진행하였다. 또한 여기에 정규모드해석 방법 중 최근 단백질을 연구함에 있어서 적용된 모드축소기법을 형태 변화 연구에 새롭게 적용하여 모드해석을 수행할 때에 축소된 모드를 통하여 해석함으로써 보다 적은 모드를 이용하여도 기존과 유사한 결과가 나옴을 언급하고자 한다. 이를 실제와 유사한 구조 변화로 진행하기 위하여 에너지 안정화를 Go-model을 이용하기로 한다.
목차
Contents ????????????????????????????????????????????????????????????? ⅰAbstract ??????????????????????????????????????????????????????????????? ⅱList of Figures ????????????????????????????????????????????????????????? ⅲ제 1 장. 서론 ??????????????????????????????????????????????????? 11.1 연구 배경 및 목적 ????????????????????????????????????????? 11.2 연구내용 ???????????????????????????????????????????????????? 5제 2 장. 모드축소기법을 통한 알고리즘 구성 ???????????? 72.1 단백질 모델 ????????????????????????????????????????????? 72.2 탄성네트워크 모델 ????????????????????????????????????? 92.3 모드축소기법 ???????????????????????????????????????????? 102.4 축소된 모드를 통한 좌표 변화 ????????????????????????? 132.5 에너지 안정화 ????????????????????????????????????????? 152.6 알고리즘 ??????????????????????????????????????????????? 17제 3 장. 결과 ?????????????????????????????????????????????????? 193.1 Adenylate Kinase ????????????????????????????????? 233.2 LAO Binding Protein ????????????????????????????? 303.3 Maltodextrin Binding Protein ?????????????????????????????? 373.4 Oligo-peptide Binding Protein ????????????????????????????? 443.5 D-ribose Binding Protein ????????????????????? 513.6 DNA Beta-Glucosyltranseferase ??????????????????????????? 573.7 Diaminopimelic Acid Dehydrogenase ?????????????????????? 64제 4 장. 결론 ?????????????????????????????????????????????????? 71참고문헌(References) ?????????????????????????????????????? 72국문초록(Korean Abstract) ?????????????????????????????? 75
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