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논문 기본 정보

자료유형
학위논문
저자정보

정인혜 (한남대학교, 한남대학교 대학원)

발행연도
2014
저작권
한남대학교 논문은 저작권에 의해 보호받습니다.

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이 논문의 연구 히스토리 (3)

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2012년 2월 남태평양 미크로네시아 Chuuk에서 채집한 9개체 해양 해면을 이용하여 같은 종 두 개체, 서로 다른 두 종, 같은 속 두 개체, 같은 속 세 개체에 따른 해면 공생세균 군집 구조의 차이 및 계통학적 다양성을 16S rRNA gene PCR-DGGE 방법을 사용하여 조사하였다. Dactylospongia metachromia 두 개체를 이용하여 DGGE 분석을 수행한 결과, 동종인 두 개체의 해면에서 동일한 밴드 패턴을 나타내었다. D. metachromia 122CH607과 122CH840의 공생세균 군집구조는 6문 8강으로 구성되어 동일한 공생세균 군집구조를 나타내었다. Cinachyrella sp.와 Plakortis sp.의 두 종의 해면에서는 해면 종간의 서로 다른 밴드 패턴을 나타내었다. Cinachyrella sp. 122CH609의 공생세균 군집구조는 4문 6강으로 구성되었으며, Plakortis sp. 122CH848의 공생세균 군집구조는 5문 7강으로 구성되었다. 그 결과, 동일한 장소에서 채집된 서로 다른 두 종의 해면의 전체 세균 군집은 차이를 나타낸 것을 확인할 수 있었다. Spongia sp. 122CH708과 Spongia sp. 122CH711의 공생세균 군집구조는 5문 6강으로 동일하게 구성되었다. Spongia sp. 122CH708과 Spongia sp. 122CH711의 밴드 패턴과 공생세균 군집구조는 동일하였으므로 두 해면은 동종인 것으로 추정된다. 같은 속, 세 개체의 Agelas sp. 해면에서 서로 다른 밴드 패턴이 나타났다. Agelas sp. 122CH619의 세균군집은 5문 6강으로 나타났으며, Agelas sp. 122CH637의 경우 4문 6강, Agelas sp. 122CH822의 경우 5문 7강으로 구성되었다. 따라서 Agelas 속의 세 개체 해면은 공생세균 군집구조에 있어 차이를 나타내어 서로 다른 해면 종임을 시사하였다. 본 연구에서 실험한 9개체의 해면에서 Alphaproteobacteria가 공통으로 존재 하였으며, Acidobacteria, Actinobacteria, Bacteroidetes, Chloroflexi, Cyanobacteria, Firmicutes, Nitrospira, Proteobacteria (Beta-, Delta-, Gamma-) 그리고 Spirochaetes는 해면 종에 따라 다르게 나타남을 알 수 있었다.

목차

Ⅰ. 서론 1
Ⅱ. 재료 및 방법 4
1. 재료 4
1-1. 해면시료의 채집 4
2. 방법 8
2-1. Total genomic DNA 추출 8
2-2. 16S rRNA gene의 DGGE-PCR 증폭 8
2-3. DGGE 전기영동 9
2-4. DGGE band의 동정 9
2-5. 계통학적 분석 및 계통수 작성 10
Ⅲ. 결과 11
1. 같은 종 두 개체에 따른 해면 공생세균 군집 구조 비교 11
1-1. DGGE band 양상 11
1-2. 염기서열 분석 및 계통학적 분석 13
2. 서로 다른 두 종에 따른 해면 공생세균 군집 구조 비교 19
2-1. DGGE band 양상 19
2-2. 염기서열 분석 및 계통학적 분석 21
3. 같은 속 두 개체에 따른 해면 공생세균 군집 구조 비교 27
3-1. DGGE band 양상 27
3-2. 염기서열 분석 및 계통학적 분석 29
4. 같은 속 세 개체에 따른 해면 공생세균 군집 구조 비교 35
4-1. DGGE band 양상 35
4-2. 염기서열 분석 및 계통학적 분석 37
Ⅳ. 고찰 44
Ⅴ. 참고문헌 50
Ⅵ. 적요 56
Ⅶ. Abstract 57

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