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논문 기본 정보
- 자료유형
- 학위논문
- 저자정보
- 지도교수
- 박희진
- 발행연도
- 2014
- 저작권
- 한양대학교 논문은 저작권에 의해 보호받습니다.
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MODa 알고리즘은 단백질 데이터베이스와 MS/MS 데이터로부터 동적 프로그래밍을 기반으로 PTM(Post-Translational Modifications)을 포함한 펩타이드를 동정하는 알고리즘이다. MODa에는 PTM을 한 개 이하만 허용하는 OneMOD, 그리고 복수의 개수를 허용하는 MultiMOD 두 가지 버전이 있다. MultiMOD에서 동정된 펩타이드 중, 약 99%가 두 개 이하의 PTM을 가지고 있다. 이에 착안하여 두 개 이하의 PTM을 허용하는 펩타이드를 더욱 효율적으로 동정하고자 TwoMOD 버전을 고안하였다. 기존 MultiMOD의 시간 복잡도는 O(CmT^2N(L+R))이지만, TwoMOD에서는 O(CtN(L+R))로 향상시켰다. 실제 실험 결과, 기존의 MultiMOD에 비하여 약 30%의 시간이 단축되었으며, 두 개 이하의 PTM을 갖는 펩타이드도 성공적으로 동정하였다.
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