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논문 기본 정보

자료유형
학위논문
저자정보

강대웅 (인하대학교, 인하대학교 대학원)

지도교수
심정섭
발행연도
2014
저작권
인하대학교 논문은 저작권에 의해 보호받습니다.

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이 논문의 연구 히스토리 (3)

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근사문자열매칭 문제는 컴퓨터보안, 검색엔진, 생물정보학과 같은 다양한 분야에서 연구되고 있다. 또한 근사문자열매칭 문제는 불일치를 판단하는 척도로 거리함수를 사용한다. 대표적인 거리함수로 편집거리와 확장편집거리가 이용된다. 알파벳 의 문자들로 구성된 길이가 각각 m,n 인 두 문자열 X,Y 의 편집거리는 를 로 변환하기 위해 필요한 최소 편집연산의 수로 정의된다. 이 때 편집연산은 삽입, 삭제, 교체연산으로 구성된다. 한편, 편집연산에 교환연산을 추가한 확장편집연산과 이를 이용한 확장편집거리도 연구되어 왔다. 두 문자열의 확장편집거리는 를 로 변환하기 위해 필요한 최소 확장편집연산의 수로 정의된다. X, Y 의 확장편집거리는 동적프로그래밍 기법을 이용하여 O(mn) 시간과 공간을 이용하여 계산할 수 있다. 본 논문에서는 길이가 각각 m, n인 두 문자열의 확장편집거리를 최대 m개의 쓰레드를 이용하여 O(m+n)시간과 O(mn)공간을 이용하여 계산하는 병렬알고리즘을 제시한다. 그리고 확장편집거리를 계산하는 순차알고리즘과 병렬알고리즘을 각각 CPU와 GPU 기반으로 구현하여 두 알고리즘의 수행시간을 비교한다. 실험 결과 두 문자열의 길이가 각각 10,000일 때, 병렬알고리즘이 순차알고리즘에 비하여 4배 빠른 수행시간을 보였다.

목차

제1장 서론 1
제2장 관련연구 4
2.1. 편집거리 계산 알고리즘 4
2.2. 확장편집거리 계산 알고리즘 6
제3장 확장편집거리 병렬 알고리즘과 CUDA 구현 9
3.1. 병렬화 전략 9
3.2. 전처리 단계 11
3.3. 계산 단계 15
제4장 실험 결과 및 분석 18
제5장 결론 21
참고 문헌 22

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