메뉴 건너뛰기
.. 내서재 .. 알림
소속 기관/학교 인증
인증하면 논문, 학술자료 등을  무료로 열람할 수 있어요.
한국대학교, 누리자동차, 시립도서관 등 나의 기관을 확인해보세요
(국내 대학 90% 이상 구독 중)
로그인 회원가입 고객센터 ENG
주제분류
인문학
인문학 일반 역사학 철학 종교학 어문학 기타 인문학
사회과학
사회과학 일반 경영학 관광학 교육학 군사학 문헌정보학 법학 사회학 신문방송학 심리과학 정치외교학 지리학 행정학 경제학 무역학 인류학 기타 사회과학
자연과학
자연과학 일반 물리학 생물학 생활과학 수학·통계학 천문학 지구과학 화학 기타 자연과학
공학
공학 일반 건축공학 기계공학 산업공학 재료·에너지공학 전기전자공학 조선해양공학 화학공학 컴퓨터학 기타공학
의약학
의학 일반 간호학 수의학 약학 한의학 기초의학 임상의학 기타 의약학
농수해양학
농수해양학 일반 농학 수산학 식품과학 임학 축산학 해상운송학 기타 농수해양학
예술체육학
예술 일반 디자인 미술 미용 사진 음악학 의상 체육 공연매체예술 기타 예술체육학
복합학
학제간연구 과학기술학 뇌인지과학 기술정책 기타 복합학

ENG

추천
검색

논문 기본 정보

자료유형
학위논문
저자정보

Jana Jeevan Rameneni (충남대학교, 충남대학교 대학원)

지도교수
임용표(Yong Pyo Lim)
발행연도
2014
저작권
충남대학교 논문은 저작권에 의해 보호받습니다.

이용수0

표지
AI에게 요청하기
추천
검색

이 논문의 연구 히스토리 (3)

2021

Comparative Transcriptome-Based Mining of Senescence-Related MADS, NAC, and WRKY Transcription Factors in the Rapid-Senescence Line DLS-91 of Brassica rapa
Jana Jeevan Rameneni ,  So Young Yi ,  Myungjin Lee 외 5명 한국원예학회 학술발표요지 2021.10 학술대회자료

2014

Genome-wide Identification, Characterization, and Comparative Phylogeny Analysis of MADS-box Transcription Factors in Brassica rapa
Jana Jeevan Rameneni 원예학과 2014.01 학위논문
Genome-wide identification, characterization, and comparative phylogeny analysis of MADS-box transcription factors in Brassica rapa
Jana Jeevan Rameneni ,  임용표 /Yong Pyo Lim ,  Vignesh Dhandapani 외 6명 Genes & Genomics 2014.01 학술저널

초록· 키워드

오류제보하기
The involvement of MADS-box transcription factors in the development of seeds, flowers, and fruit is well known. Large number of MADS-box genes have been characterized and reported in major plants such as Arabidopsis thaliana (107), Oryza sativa (75), Zea mays (75), and Cucumis sativus (43). However, there is little information about MADS-box genes in the economically and morphologically important genus Brassica. Thus, we performed a series of computational analyses on the recently published Brassica rapa genome and identified 167 potential MADS-box genes. Chromosomal localization of these genes revealed many duplicate genes and 10 tandem repeats from B. rapa chromosomes, though none on A04, A08, and A10.Neighbor-joining phylogenetic analysis was performed between B. rapa, A. thaliana, O. sativa, Z. mays, and C. sativus genes, and type-I and type-II groups were differentiated by their gene clades. Based on their phylogeny and functional characters, type-I group was divided into three clades and type-II group into 14clades. Prediction and comparison of intron and exon patterns of MADS-box genes authenticates the major difference between the groups. Semi-quantitative RT-PCR analysis was carried out for 25 functionally categorized BrMADS-box genes and comparatively studied among buds, sepals, petals, stamens, carpels, and siliques of the parental line Rapid Cycling Brassica rapa (RcBr). The structural and functional annotation, as well as expressional profiling of BrMADS in floral organs in this study will be the basis of further functional validation and molecular breeding of B. rapa crops.

목차

I. Introduction 1
II. Materials and Methods 6
1. Identification of MADS-box genes in B. rapa 6
2. Intron/exon structure 6
3. Identification of conserved motifs 6
4. Annotation of gene ontology 7
5. Phylogenetic analysis 7
6. Expression analysis of MADS box genes in B. rapa 7
III. Results and Discussion 10
1. Identification and chromosomal localization of MADS-box genes in the genome of
B. rapa 10
2. Intron/Exon structure and duplication analysis 19
3. Comparative phylogenetic analysis and conserved motif identification of MADS- box genes in B. rapa, A. thaliana, O. sativa, Z. mays and C. sativus 22
4. Functional classification of B. rapa MADS-box genes 30
5. Expression analysis of 25 B. rapa MADS-box genes 33
IV. Conclusion 36
V. Literature cited 37
Abstract 42
Korean Abstract 44
Acknowledgement 45

최근 본 자료

전체보기

댓글(0)

0