쉬리속 어류의 분류학적 연구를 위해 계수·계측형질과 외부형질 등 형태적 분석과 분자계통학적 분석을 수행하였으며, DNA 함량 분석 및 종간 잡종 교배실험을 수행하였다. 또한 집단유전학적 연구를 위해 CO1 유전자와 Microsatellite 마커에 의한 집단구조분석과 동해안 수계 쉬리속 어류의 기원과 낙동강 황지천 잡종 개체군의 유전자 변이를 분석하였다.

1. Coreoleuciscus 속 어류의 분류
쉬리 Coreoleuciscus splendidus와 참쉬리 C. aeruginos는 등지느러미와 꼬리지느러미에 분포하는 반문의 모양과 뒷지느러미 기저부에 존재하는 반문의 유무를 기준으로 종 분류가 가능하였다. 등지느러미의 경우 쉬리는 불연속적인 2개의 반문이 상 · 하 층으로 분리되어 있는 형태를 가지고 있는 반면에 참쉬리는 연속적인 얇은 띠의 형태를 가지고 있었다. 뒷지느러미는 두 종 모두 지느러미에 길게 신장된 검은 반문을 가지고 있으나 쉬리에서만 뒷지느러미 기저부에 반문이 존재하는 차이점을 보인다. 꼬리지느러미에 분포하는 검은색의 반문은 두 종의 대표적인 형태적인 차이로써 쉬리는 7개의 선형반문이 중심대칭구조(centrosymmetric)를 이루고 있으며 꼬리지느러미 기저부에 위치한 원형의 반문과 지느러미 중앙에 위치한 얇은 2개의 직선형 반문을 기준으로 상엽과 하엽에 반문이 각 2개씩 위치하여있다. 반면에 참쉬리는 3개의 선형의 반문이 중심대칭구조를 이루며, 지느러미 말단을 따라서 연속적으로 이어져 있는 선형의 반문을 가지고 있다. 더불어 지느러미 기저부에 원형의 반문을 기준으로 지느러미 상엽과 하엽을 나누는 굵고 짧은 반문이 각 1개씩 총 2개가 위치하고 있다.
또한 두 종은 체측의 줄무늬 색에서 차이가 나타나며, 쉬리는 주황색, 금색, 검은색을 띄는 3열의 띠의 형태로 배열되어 있는 반면에 참쉬리는 체측에 주황색, 청록색의 순으로 나타난다. 혼인색의 경우 쉬리의 혼인색은 밝은 노란색, 보라색, 푸른색 순으로 구성되어 있으며, 참쉬리는 주황색과 검은색으로만 구성된 혼인색으로 차이를 보였다. 반면 계수·계측형질의 경우 쉬리와 참쉬리는 문장, 안경, 체장에 대한 등지느러미 기점거리 등의 일부 계측형질에서 다소 차이를 나타내었으나, 계수형질에서는 두 종간 차이를 확인할 수 없었다. 하지만 두 종은 지느러미에 존재하는 반문의 차이점과 체색 및 혼인색에서 나타나는 특징들이 종간 큰 차이를 보여 두 종을 구분하는 분류 형질로써 사용이 가능하였다.
DNA 함량 분석결과 두 종간에 유의한 차이를 보였고 CO1 유전자와 RAG1 유전자를 통한 분자계통 분석결과 쉬리와 참쉬리는 뚜렷하게 계통이 분리되어 있었으며, 쉬리는 한강과 금강 수계 집단으로 구성되어 있었고 참쉬리는 섬진강과 낙동강 수계의 2개의 집단으로 구성되었다. 두 종간의 생식적인 격리를 확인하기 위해 인위적인 잡종유도를 실시한 결과 잡종 F1세대 형성에 전혀 문제가 없는 것으로 나타났다.

2. Coreoleuciscus 속 유전적 집단구조
미토콘드리아 DNA의 CO1 유전자를 대상으로 수계별 쉬리 집단에 대한 집단유전학적 분석 결과 한강과 금강 집단 사이에 0.7817~1.000 (P<0.05)의 높은 유전적 분화도 값을 보였다. 평균 haplotype 다양성과 nucleotide 다양성은 각각 0~0.9211, 0~0.0012의 범위로 조사되었다. 쉬리 한강 집단에 대한 microsatellite 분석결과 평균 대립유전자 수는 6.3~11.4개, 평균 관찰치와 기대치 이형접합률은 각각 0.572~0.831, 0.610~0.857의 범위로 조사되었으며, 최근의 병목현상 추정결과 모든 집단에서 통계적으로 유의하지 않았고 유전적 구조 분석결과 서식하는 수계를 기준으로 한강과 금강의 두 집단으로 구성되어 있었다.
수계별 참쉬리 집단에 대한 집단유전학적 분석 결과 섬진강과 낙동강 집단 사이에 0.9567~0.9909 (P<0.05)의 높은 유전적 분화도 값을 보였다. 평균 haplotype 양상과 nucleotide 다양성은 각각 0~0.6474, 0~0.0005의 범위로 조사되었다. 참쉬리 낙동강 집단에 대한 microsatellite 분석 결과 평균 대립유전자 수는 7.7~11.2개, 평균 관찰치와 기대치 이형접합률은 각각 0.536~0.636, 0.701~0.801의 범위로 조사되었고 최근의 병목현상 추정결과 밀양강 집단에서 병목현상이 추정되었으며, 유전적 구조 분석결과 서식하는 수계를 기준으로 섬진강과 낙동강의 두 집단으로 구성되어 있었다.
동해안 독립하천을 대상으로 쉬리속 어류의 분포를 조사한 결과 연곡천, 강릉남대천, 삼척오십천에는 쉬리가 분포하고 있으며, 영덕오십천에는 참쉬리가 분포하고 있는 것으로 조사되었다. 이 중, 쉬리가 서식하는 연곡천, 강릉남대천, 삼척오십천 집단은 문헌조사 및 분자생물학적 분석 결과 남한강 집단의 일부가 하천쟁탈 등의 원인으로 자연 분포하는 집단으로 추정 되었으나 영덕오십천에 분포하는 참쉬리 집단은 인위적인 요인으로 인해 이입된 집단인 것으로 추정되었다.
낙동강 황지천 참쉬리 집단을 대상으로 채집조사와 유전자 분석을 실시한 결과 쉬리속 어류 2종이 황지천에서 동서하고 있는 것으로 확인되었다. 이들 개체군의 유전형 분석 결과 남한강 집단의 유전형과 동일한 쉬리 개체군과 낙동강 집단의 유전형과 동일한 참쉬리 개체군으로 밝혀져 한 지역에 두 가지의 유전형이 존재하고 있는 것으로 확인되었으며, 두 종간 교배로 인한 자연잡종 개체군이 확인되었다. 따라서 낙동강 황지천에는 남한강의 쉬리 개체군 일부가 인위적인 요인으로 이입된 것으로 추정되며, 이로 인해 두 종간 교배에 따른 자연 잡종 개체군이 발생하여 낙동강 참쉬리 집단의 유전자 변이가 나타나고 있는 것으로 확인되었다.

For the taxonomy studies of genus Coreoleuciscus species, measurements, meristic counts and morphometric character and phylogenetic analysis were conducted, and DNA contents analysis and interspecies hybridization experiments were carried out. In addition, the population structure analysis by CO1 gene and microsatellite marker, the origin of genus Coreoleuciscus of the river basins in the east coast, and genetic variation analysis of natural hybrid population at Hwang-ji stream (Nakdong river) were accomplished.
Chapter 1. Taxonomy study of genus Coreoleuciscus species
The two species are futher distinguished by the shape and/or presence of black bands on dorsal, anal and caudal fin rays. Dorsal fin of C. splendidus with a thick and discontinuous distal band and a thick and continuous basal band (versus C. aeruginos with a thin and continuous band both distally and basally). C. splendidus a has anal fin of quite thick and long distal dark band and short basal band (versus C. aeruginos has anal fin of thin and relatively short distal band and no basal band).
Between the two species, there are multiple notable differences in caudal fin. C. splendidus with a total of seven bands in centrosymmetric structure; three pairs of six thin bands separated into two lobes at medial and distal-most areas and a thin basal band extending outwards. In contrast, C. aeruginos with three stripes in centrosymmetric structure; a thick and continuously band distally across lobes, one pair of two thick bands separated into two lobes medially, and a thick and short one at the basal part.
Coreoleuciscus aeruginos is distinguished from C. splendidus using body coloration. C. splendidus has a golden line immediately above a luteous line that runs along a lateral line on side of body and C. aeruginos has a bluish-green line above the luteous line. During the spawning season, C. splendidus has a bright yellow line immediately above a violet and bluish line running along lateral line on side body while C. aeruginos has a luteous line immediately above a black line.
Phylogenetic analysis inferred from CO1 and RAG1 gene sequence data revealed that Coreoleuciscus populations from South Korea form two independent lineages, the C. splendidus lineage comprising the Han/Geum river populations (West Korea subdistrict), and the C. aeruginos lineage comprising the Seomjin/Nakdong river populations (South Korea Subdistrict) and each lineage was supported by the highest statistical support. Distinct differences in meristic counts and measurements were not identified between C. splendidus and C. aeruginos. In contrast, this study found a high degree of morphological differentiation between the two species in body coloration, nuptial coloration, and shapes of black stripes on the dorsal, anal, and caudal fin rays.

Chapter 2. Genetic population structure of genus Coreoleuciscus species
Sequence analysis of the C. splendidus Han River and Geum River populations revealed that the CO1 gene showed the FST value to range from 0.7817-1.000 (P<0.005). The average haplotype and nucleotide diversities to range from 0 to 0.9211 and 0 to 0.0012, respectively. Ten polymorphic microsatellite DNA loci were characterized un 160 individuals from the eight populations. The average number of allele range from 6.3 to 11.4, and the average observed and expected heterozygosities ranged from 0.572-0.831 and from 0.610 to 0.857, respectively. Eight populations of C. splendidus were not discovered to the population bottleneck. Analysis of the genetic structure based on genetic distance and differentiation were discovered the significant differences between Han River and Geum River populations.
Sequence analysis of the C. aeruginos Han River and Geum River populations revealed that the mitochondrial CO1 gene showed the FST value to range from 0.9567-0.9909 (P<0.005). The average haplotype and nucleotide diversities to range from 0 to 0.6474 and 0 to 0.0005, respectively. Ten polymorphic microsatellite DNA loci were characterized un 160 individuals from the eight populations. The average number of allele range from 7.7 to 11.2, and the average observed and expected heterozygosities ranged from 0.536-0.6.36 and from 0.701 to 0.801, respectively. Milyang River populations were discovered to experience the recent population bottleneck. Analysis of the genetic structure based on genetic distance and differentiation were discovered the significant differences between Seom River and Nakdong River populations.
The microdistribution and distributional aspect of C. splendidus and C. aeruginos from the river basins on the east coast from 2009 to 2015. This specis was found in four independent streams of the east coast of the south Korea. C. splendidus were microdistristrubution of the east coast at Yeongok stream, Gangneungnamdae Stream, Samcheok-osip stream, and C. aeruginos was found in only one habitat at yeongdeok-osip stream. However, were not found in seven streams from Baebong, Ssang, Yangyangnamdae. Jusu, Maeup, Gagok, Uljin-wangpi streams. This species distributional zone was in the middle or upper riffles of main stream and tributaries.
A natural interspecific hybrids between two Coreoleuciscus species C. splendidus and C. aeruginos was collected in their sympatric area, Hwangji stream, the Nakdong river. Morphological characters as well as RAG1 gene and CO1 gene were investigated to confirm the natural hybrid origin. Both the induced hybrids and their reciprocal counterparts displayed the double peaks of sequence chromatograms at the 13 diagnostic positions. In analysis of CO1 gene, it revealed that the maternal species of the natural hybrid appeared to be C. splendidus and C. aeruginos due to their 100% sequence identity. Thus, such result gave convincing evidence for the occurrence of a natural interspecies hybrid between C. splendidus and C. aeruginos. Therefore, the C. speldndisus populations have been introduced in the Nakdong river at recent years.