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논문 기본 정보

자료유형
학위논문
저자정보

이지윤 (군산대학교, 군산대학교 대학원)

발행연도
2018
저작권
군산대학교 논문은 저작권에 의해 보호받습니다.

이용수7

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이 논문의 연구 히스토리 (2)

2018

원황배(Pyrus pyrifolia) 유전체 해독을 기반으로 한 SSR 마커 개발 및 유전자 지도 작성
이지윤 생물학과 2018.01 학위논문
배 ‘원황’(Pyrus pyrifolia) 유전체 해독에 기반한 SSR 마커 개발 및 유전자 지도 작성
이지윤 ,  서미숙 ,  원소윤 외 4명 한국육종학회지 2018.01 학술저널

초록· 키워드

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배(Pyrus spp.)는 세계에서 가장 중요한 온대 과수 중 하나로, 장미과(Rosaceae) 배나무아과(Pomoideae) 배나무속(Pyrus)에 속하는 다년생 식물이다.
본 연구에서는 원황배(Pyrus pyrifolia) 스캐폴드에서 제작된 SSR 마커를 이용하여 배의 유전자 지도를 작성 하였다. 제작된 24,267개 SSR primer 중에서 3,200개의 primer를 이용하였고, BLAST 프로그램을 통하여 식물에서 전사인자(transcription factor), 저항성 단백질과 같이 중요 기능과 관련된 유전자와 유사성이 높은 primer를 선발하였다. 선발된 primer는 유전자 증폭 및 확인을 통하여 genotype을 분석하였고, 공우성(co-dominant) 밴드와 다형성(polymorphism)을 나타내는 88개의 simple sequence repeat (SSR) 마커를 선발하였다. 88개의 SSR 마커와 기존의 1,019개의 SNP 마커를 포함하는 1,107개의 마커는 ‘원황’(Pyrus pyrifolia) × ‘Bartlett’(Pyrus communis) F1 집단의 유전자 지도를 제작하는데 사용되었고, 최종적으로 78개의 SSR 마커와 892개의 SNP 마커가 맵핑되었다. 유전자 지도는 7번 염색체를 제외하고는 단일 그룹으로 형성되었으며, 6,065.2 cM의 총 길이를 나타냈고, 각 마커 간의 평균 거리는 6.4 cM 이였다. 각각의 유전자 지도에는 1개에서 9개의 SSR 마커가 부착되었다. 이러한 유전자 지도는 양적 형질 유전자좌(Quantitative Trait Locis, QTLs)의 위치를 예측하거나, 분자 표지 이용 선발(marker-assisted selection, MAS)을 가능하게 하는 등 배의 육종 및 유전 연구에 유용한 정보를 제공할 것으로 보인다.

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