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저널정보
Korean Institute of Information Scientists and Engineers 정보과학회논문지 : 시스템 및 이론 정보과학회논문지 : 시스템 및 이론 제29권 제9·10호
발행연도
2002.10
수록면
514 - 519 (6page)

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단백질의 구조를 예측하는 과정에 사용될 수 있는 다음 문제를 고려한다. 길이가 n 이고 원소가 모두 양수인 두 배열 A, B 와 양수 M 이 주어질 때, A[i]+ … +A[j]+B[k]+ … +B[l] = M 이 되는 부배열 쌍 A[i],…, A[j] , 1≤i≤j≤n 과 B [k],…, B [l], 1≤k≤l≤n을 모두 찾으시오. 본 논문에서는 이 문제를 O(n²log n + K) 시간에 O(n) 메모리를 사용하여 해결하는 알고리즘을 제시한다. 단, K는 찾은 부배열 쌍의 수이다. 기존의 결과는 O(n²log n + K log n) 시간과 O(n) 메모리였다.

목차

요약

Abstract

1. 생물정보학적인 동기

2. 문제 정의와 간단한 해법

3. 메모리 양을 줄이는 방법

4. 답 출력시간을 줄이는 방법

5. 결론

참고문헌

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