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A gene coding for xylanase from alkali-tolerant Bacillus alcalophilus AX2000 was cloned into Escherichia coli DH5α using pUC19. Among 2,000 transformants, one transformant showed clear zone on the detection agar plate containing oat-spelts xylan. Its recombinant plasmid, named pXTY99, was found to carry 7.0 kb insert DNA fragment. When the nucleotide sequence of the cloned xylanase gene (xynT) was determined, xynT gene was found to consist of 1,020 base-pair open reading frame coding for a polypeptide of 340 amino acids with a deduced molecular weight of 40 kDa. The coding sequence was preceded by a putative ribosome binding site, and the transcription initiation signals. The deduced amino acid sequence of xylanase is similar to those of the xylanases from Bacillus sp. N137 and B. stearothermophilus 21 with 61% and 59% identical residues, respectively.
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Kulkarni, N., A. Shendye, M. Rao. 1999. Molecular and biotechological aspects of xylanases. FEMS Microbiol. Rev. 23, 411-456.
McCarthy, A. A., D. D. Morris, P. L. Bergquist and E. N. Baker. 2000. Structure of XynB, a highly thermostable beta-1,4-xylanase from Dictyoglomus thermophilum Rt46B.1, at 1.8 A resolution. Acta Crystallogr. D. Biol. Crystallogr. 11, 1367-1375.
Moran C. P. Jr, N. Lang, S. F. LeGrice, G. Lee, M. Stephens, A. L. Sonenshein, J. Pero and R. Losick. 1982. Nucleotide sequences that signal the initiation of transcription and translation in Bacillus subtilis. Mol. Gen. Genet. 186, 339-346.
Park, Y. S. and T. Y. Kim. 2003. Isolation of Bacillus alcalophilus AX2000 producing alkaline xylanase and its enzyme production, Korean J. Microbol. Biotechnol. 31, 157-164.
Sambrook, J. and D. Russell. 2001. Molecular cloning - A laboratory manual. 3rd eds., CSHL Press. Cold Spring Harbor, New York.
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Moran C. P. Jr, N. Lang, S. F. LeGrice, G. Lee, M. Stephens, A. L. Sonenshein, J. Pero and R. Losick. 1982. Nucleotide sequences that signal the initiation of transcription and translation in Bacillus subtilis. Mol. Gen. Genet. 186, 339-346.
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