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알긴산을 분해하기 위하여 갈조류로부터 분해활성이 있는 해양미생물을 분리하였다. 분리된 균주의 16S ribosomal DNA를 분석한 결과 이전에 보고했던 ALG-5 균주와 비슷한 Streptomyces sp.에 속하는 것으로 나타났다. 상동성이 있는 염기서열로 고안한 특이적인 primer로 PCR을 행함로서 Streptomyces sp. M3의 새로운 alginate lyase 유전자를 클로닝하였다. M3 alginate lyase의 예상 아미노산 서열에는 N-terminal 영역에 YXRSELREM 서열과 C-terimnal 영역에 YFKAGXYXQ 서열이 보존되어 있었다. M3 alginate lyase 단백질의 homology model은 Corynebacterium sp. ALY-1으로부터 얻은 단백질인 alyPG와 같이 β-jelly roll fold를 main domain으로 가지고 있음이 나타났다. M3 alginate lyase 유전자를 가지는 재조합 E. coli의 세포균질액은 polymannuronate block보다는 polyguluronate block에 대하여 높은 분해력을 가지고 있었다. 아미노산 서열 다중정열 및 homology modeling으로부터 얻은 결과는 M3 alginate lyase가 Family PL-7으로 분류될 수 있음을 말해 준다.
목차
Introduction
Materials and Methods
Results and Discussion
Acknowledgement
References
초록
참고문헌 (22)
참고문헌 신청
1. [학술지(정기간행물)] - Akiyama, H. / 1992 / Effect of depolymerized alginates on the growth of bifidobacteria / Biosci. Biotechnol. Biochem. 56 : 355 ~ 356
2. [학술지(정기간행물)] - Cao, L. / 2007 / Purification and characterization of alginate lyase from Streptomyces species strain A5 isolated from banana rhizosphere / J. Agric. Food. Chem. 55 : 5113 ~ 5117
3. [학술지(정기간행물)] - 최성희 / 2008 / 해양 어류 Mugil cephalus 유래의 에폭사이드 가수분해효소를 이용한 라세믹 styrene oxide의 입체선택적 분할 반응 / 공업화학 19 (5) : 491 ~ 496
4. [학술지(정기간행물)] - Cote, G. L / 1988 / Characterization of the extracellular polysaccharides from Azotobacter chroococcum / Carbohydr. Res. 181 : 143 ~ 152
5. [학술지(정기간행물)] - Fan, M. Y. / 1990 / Reversal of diabetes in BB rats by transplantation of encapsulated pancreatic islets / Diabetes 39 : 519 ~ 522
2. [학술지(정기간행물)] - Cao, L. / 2007 / Purification and characterization of alginate lyase from Streptomyces species strain A5 isolated from banana rhizosphere / J. Agric. Food. Chem. 55 : 5113 ~ 5117
3. [학술지(정기간행물)] - 최성희 / 2008 / 해양 어류 Mugil cephalus 유래의 에폭사이드 가수분해효소를 이용한 라세믹 styrene oxide의 입체선택적 분할 반응 / 공업화학 19 (5) : 491 ~ 496
4. [학술지(정기간행물)] - Cote, G. L / 1988 / Characterization of the extracellular polysaccharides from Azotobacter chroococcum / Carbohydr. Res. 181 : 143 ~ 152
5. [학술지(정기간행물)] - Fan, M. Y. / 1990 / Reversal of diabetes in BB rats by transplantation of encapsulated pancreatic islets / Diabetes 39 : 519 ~ 522
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