디지털 PCR을 응용한 특정 amoA 유전자를 가진 질산화 Archaea 동정

박병준; 박수제; 이성근

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자료유형: 학술저널

저자정보: 박병준 (충북대학교) 박수제 (충북대학교) 이성근 (충북대학교)

저널정보: 한국미생물학회 미생물학회지 미생물학회지 43권 3호

발행연도: 2007.9

수록면: 232 - 235 (4page)

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해양 및 토양에서의 암모니아 산화는 세균에 비해 Crenarchaeota그룹의 archaea에 의해 우세하게 일어나고 있음이 알려졌다. 서해 갯벌에서, 배양에 의존하지 않고, 특정 암모니아 산화 유전자(amoA)를 가진 archaea을 동정하고자 디지털 PCR법을 응용한 nested PCR법을 개발하였다. amoA와 16S rRNA유전자가 동시에 증폭된 샘플의 분석결과, 16S rRNA유전자에 비해 amoA 유전자의 다양성이 높았으며, I.1a 그룹의 crenarchaea가 I.1b 그룹의 crenarchaea보다 갯벌지역에서 암모니아 산화에 우점적으로 기여하고 있음을 알 수 있었다. 본 연구에서 시도된, 디지털 PCR과 multiplex-nested PCR을 접목한 접근법을 이용하면 특정 기능유전자를 가진 미생물을 환경에서 검증하는데 응용할 수 있을 것이다.

#amoA #digital PCR #diversity #nitrifying archaea #tidal flat #16S rRNA gene

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1. [학술지(정기간행물)] - / 2003 / Reductive dehalogenation of brominated phenolic compounds by microorganisms associated with the marine sponge Aplysina aerophoba 69 : 4159 ~ 4166

2. [학술지(정기간행물)] - / 2000 / Who is out there Microbial aspects of biodiver sity 23 : 1 ~ 8

3. [학술지(정기간행물)] - / 2006 / Diversity of ammonia oxidizing archaea and bacteria in the sediment of a hypernutrified subtropical estuary Bahia del Tobari 72 : 7767 ~ 7777

4. [학술지(정기간행물)] - / 2003 / Diversity and seasonal variability of β Proteobacteria in biofilms of polluted rivers analysis by temperature gradient gel electrophoresisand cloning 69 : 4463 ~ 4473

5. [학술지(정기간행물)] - / / E.F. 1992. Archaea in coastal marine environments. Proc. Natal Acad. Sci. USA. 89 : 5685 ~ 5689

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