메뉴 건너뛰기
.. 내서재 .. 알림
소속 기관/학교 인증
인증하면 논문, 학술자료 등을  무료로 열람할 수 있어요.
한국대학교, 누리자동차, 시립도서관 등 나의 기관을 확인해보세요
(국내 대학 90% 이상 구독 중)
로그인 회원가입 고객센터 ENG
주제분류
인문학
인문학 일반 역사학 철학 종교학 어문학 기타 인문학
사회과학
사회과학 일반 경영학 관광학 교육학 군사학 문헌정보학 법학 사회학 신문방송학 심리과학 정치외교학 지리학 행정학 경제학 무역학 인류학 기타 사회과학
자연과학
자연과학 일반 물리학 생물학 생활과학 수학·통계학 천문학 지구과학 화학 기타 자연과학
공학
공학 일반 건축공학 기계공학 산업공학 재료·에너지공학 전기전자공학 조선해양공학 화학공학 컴퓨터학 기타공학
의약학
의학 일반 간호학 수의학 약학 한의학 기초의학 임상의학 기타 의약학
농수해양학
농수해양학 일반 농학 수산학 식품과학 임학 축산학 해상운송학 기타 농수해양학
예술체육학
예술 일반 디자인 미술 미용 사진 음악학 의상 체육 공연매체예술 기타 예술체육학
복합학
학제간연구 과학기술학 뇌인지과학 기술정책 기타 복합학

ENG

추천
검색
질문

논문 기본 정보

자료유형
학술저널
저자정보
권선영 (서울대학교) 이병한 (서울대학교) 박승현 (서울대학교) 조정희 (서울대학교) 윤성로 (서울대학교)
저널정보
Korean Institute of Information Scientists and Engineers 정보과학회 컴퓨팅의 실제 논문지 정보과학회 컴퓨팅의 실제 논문지 제23권 제4호
발행연도
2017.4
수록면
250 - 255 (6page)

이용수

표지
📌
연구주제
📖
연구배경
🔬
연구방법
🏆
연구결과
AI에게 요청하기
추천
검색
질문

이 논문의 연구 히스토리 (2)

2017

시퀀스 유사도에 기반한 유전체 데이터베이스 압축 및 영향 분석
권선영 ,  이병한 ,  박승현 외 2명 정보과학회 컴퓨팅의 실제 논문지 2017.04 학술저널

2016

시퀀스 유사도에 따른 유전체 데이터베이스 압축
권선영 ,  이병한 ,  박승현 외 2명 한국정보과학회 학술발표논문집 2016.06 학술대회자료

초록· 키워드

오류제보하기
유전체 데이터의 급증 및 정밀의료 등 응용 분야 확대에 따라 유전체 데이터베이스의 효율적 관리에 대한 중요성이 커지고 있다. 전통적인 압축 기법을 통해 유전체 데이터를 압축할 경우, 압축효과는 크지만, 압축된 상태에서 데이터베이스를 비교하거나 검색하는 등의 작업이 용이하지 않게 된다. 유전체 데이터 분석에 소요되는 시간은 데이터베이스에 존재하는 시퀀스 수에 비례하며, 중복되거나 유사한 시퀀스가 다수 존재한다는 점에 착안하여, 본 논문에서는 유전체 데이터베이스 상에 존재하는 유사 시퀀스를 제거함으로써 전체 데이터베이스 크기를 줄이는 기법을 제안한다. 실험을 통해 시퀀스 유사도 1% 기준으로도 전체의 약 84% 시퀀스가 제거되며, 약 10배 빠른 분류분석이 가능함을 보인다. 또한 큰 폭의 압축효과에도 불구하고, 범주 다양성 및 분류 분석 등에 미치는 변화가 미미함을 확인함으로써, 시퀀스 유사도 기반의 제안 압축 기법이 유전체 데이터베이스 압축에 효과적인 방법임을 제시한다.
#시퀀스 #유전체 #데이터베이스 #압축 #유사도 #cd-hit-est #sequence #genome #database #compression #similarity

목차

요약
Abstract
1. 서론
2. 본론
3. 실험 결과
4. 결론
References

참고문헌 (12)

참고문헌 신청
Stephens, Zachary D., et al., Big data: astronomical or genomical?, PLoS Biol, 13.7 (2015): e1002195. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/refseq Altschul, Stephen F., et al., Basic local alignment search tool, Journal of molecular biology, 215.3 (1990): 403-410. Edgar, Robert C., Search and clustering orders of magnitude faster than BLAST, Bioinformatics, 26.19 (2010): 2460-2461. Cole, James R., et al., The Ribosomal Database Project: improved alignments and new tools for rRNA analysis, Nucleic acids research 37.suppl 1 (2009): D141-D145.

함께 읽어보면 좋을 논문

논문 유사도에 따라 DBpia 가 추천하는 논문입니다. 함께 보면 좋을 연관 논문을 확인해보세요!

이 논문의 저자 정보

이 논문과 함께 이용한 논문

메타유전체 분류를 위한 sparse 표현법
이태훈 ,  김세정 ,  윤성로 한국통신학회 학술대회논문집 2015 .06
In-Storage Processing 연구 동향
최혁준 ,  김세준 ,  윤성로 한국정보과학회 학술발표논문집 2016 .12
유전자 발현량 데이터의 Lasso 회귀 분석 시 부트스트랩을 통한 변수선택 안정화
조정희 ,  윤성로 한국정보과학회 학술발표논문집 2016 .12
Online Constructive Machine Learning with Molecular Hypernetworks in DNA Computing
Ch ,  istina Baek ,  Dong-Hyun Kwak 외 2명 한국정보과학회 학술발표논문집 2016 .12
Massively-Parallel Pattern Recognition through Evolutionary Molecular Hypernetwork in DNA Computing
Ch ,  istina Baek ,  Je-Hwan Ryu 외 2명 한국정보과학회 학술발표논문집 2015 .06

최근 본 자료

전체보기

댓글(0)

0