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Gwang Il Kim (Andong National University) Jee In Kim (Andong National University) Jin-Hyeap Kwon (Andong National University) Yoo Hong Min (Andong National University) Joo Il Kang (Bionics) Chang-Ho Lee (Gyeongbuk Institute for Bioindustry) Sung-Hee Kim (Animal and Plant Quarantine Agency) Jae-Hwan Lim (Andong National University)
저널정보
한국생명과학회 생명과학회지 생명과학회지 제28권 제5호
발행연도
2018.5
수록면
555 - 562 (8page)

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Swine influenza virus (SIV)는 돼지 개체군에서 가장 흔한 질병을 일으키는 바이러스 중 하나이며 그 subtype은 hemagglutinin (HA)와 neuraminidase (NA)에 의해 결정됩니다. 최근 SIV subtype 진단 방법이 개발되고 있으나 SIV의 리보뉴클레오타이드 서열의 많은 변이로 인해 PCR 보다는 항원-항체 반응을 이용하는 방법이 주로 사용되고 있다. 본 연구에서는 SIV 하위 유형의 신속한 결정을 위하여 2008년 이후 국내에서 발생한 SIV의 다중염기서열 정렬을 통하여 10개의 subtype 진단 프라이머 세트를 개발하고 이를 이용한 one-step RT-PCR 반응을 최적화하였다. 또한 감염력이 높고 독성이 있는 인플루엔자 H1N1 (pH1N1)의 아형에서 확인된 독특한 M 유전자 서열을 검출함으로써 pandemic SIV를 조기에 결정하도록 특이적 프라이머를 설계하였다. 2008년부터 2014년까지 한국에서 발생한 9종의 SIV RNA를 활용하여 SIV의 아형 및 pandemic 가능성을 결정하기 위해 시험 분석한 결과 모든 진단 프라이머 세트는 SIV 아형을 정확하게 결정하였으며 pandemic SIV를 검출할 수 있는 것으로 확인되었다. 결과적으로 이들 프라이머 세트를 이용한 최적화된 one-step RT-PCR 분석이 SIV 아형의 신속한 진단에 유용하다는 것이 확인하였다. 이러한 결과는 SIV 하위 유형 및 pandemic SIV가 확산되기 전에 조기 발견을 위한 키트로 개발될 수 있음을 시사한다.
#Diagnostic one-step RT-PCR #pandemic H1N1 #swine influenza virus

목차

Introduction
Materials and Methods
Results
Discussion
References
초록

참고문헌 (24)

참고문헌 신청
Balish, A., Garten, R., Klimov, A. and Villanueva, J. 2013. Analytical detection of influenza A (H3N2) v and other A variant viruses from the USA by rapid influenza diagnostic tests. Influenza Other Respir. Viruses 7, 491-496. Brookes, S. M., Nunez, A., Choudhury, B., Matrosovich, M. and Essen, S. C., et al. 2010. Replication, pathogenesis and transmission of pandemic (H1N1) 2009 virus in non-immune pigs. PLoS One 5, e9068. Choi, Y. K., Goyal, S. M., Kang, S. W., Farnham, M. W. and Joo, H. S. 2002. Detection and subtyping of swine influenza H1N1, H1N2 and H3N2 viruses in clinical samples using two multiplex RT-PCR assays. J. Virol. Methods 102, 53-59. Fereidouni, S. R., Starick, E., Grund, C., Globig, A., Mettenleiter, T. C., Beer, M. and Harder, T. 2009. Rapid molecular subtyping by reverse transcription polymerase chain reaction of the neuraminidase gene of avian influenza A viruses. Vet. Microbiol. 135, 253-260. Garten, R. J., Davis, C. T., Russell, C. A., Shu, B. and Lindstrom, S., et al. 2009. Antigenic and Genetic characteristics of the early isolates of Swine-origin 2009 A (H1N1) Influenza Viruses circulating in humans. Science 325, 197-201.

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