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Kook-Il Han (Korea Research Institute of Bioscience and Biotechnology) Se Won Kang (Korea Research Institute of Bioscience and Biotechnology) Ji-Sun Kim (Korea Research Institute of Bioscience and Biotechnology) Keun Chul Lee (Korea Research Institute of Bioscience and Biotechnology) Mi Kyung Eom (Korea Research Institute of Bioscience and Biotechnology) Min Kuk Suh (Korea Research Institute of Bioscience and Biotechnology) Han Sol Kim (Korea Research Institute of Bioscience and Biotechnology) Seung-Hwan Park (Korea Research Institute of Bioscience and Biotechnology) Ju Huck Lee (Korea Research Institute of Bioscience and Biotechnology) Jam-Eon Park (Korea Research Institute of Bioscience and Biotechnology) Byeong Seob Oh (Korea Research Institute of Bioscience and Biotechnology) Seung Yeob Yu (Korea Research Institute of Bioscience and Biotechnology) Seung-Hyeon Choi (Korea Research Institute of Bioscience and Biotechnology) Dong Ho Lee (Seoul National University Bundang Hospital) Hyuk Yoon (Seoul National University Bundang Hospital) Byung-Yong Kim (ChunLab) Je Hee Lee (ChunLab) Jung-Sook Lee (Korea Research Institute of Bioscience and Biotechnology)
저널정보
한국미생물학회 미생물학회지 미생물학회지 제55권 제2호
발행연도
2019.6
수록면
160 - 163 (4page)

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본 연구에서는 건강한 한국인 분변으로부터 Senegalimassilia sp. KGMB 04484 균주를 분리하였으며 PacBio Sequel 플랫폼을 이용하여 유전체서열을 분석하였다. 유전체는 G+C 구성비율이 61.18%이며, 2,300개의 유전자와 2,139개의 단백질코딩 유전자, 21개의 rRNA 및 51개 tRNA로 구성되었으며, 염색체의 크기는 2,748,041 bp였다. 유전체의 주요 특징은 가수분해효소와 지방산생합성 및 대사에 관련된 유전자를 포함한다. 이러한 유전체의 분석은 KGMB 04484 균주가 사람의 건강 및 소화에 관여할 것으로 여겨진다.
#Senegalimassilia sp. KGMB 04484 #cellulase #fatty acid #feces

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Aziz RK, Devoid S, Disz T, Edwards RA, Henry CS, Olsen GJ, Olson R, Overbeek R, Parrello B, Pusch GD, et al. 2012. SEED servers: high-performance access to the SEED genomes, annotations, and metabolic models. PLoS One 7, e48053. google schola Bairoch A and Apweiler R. 2000. The SWISS-PROT protein sequence database and its supplement TrEMBL in 2000. Nucleic Acids Res. 1, 45?48. google schola Cuevas-Sierra A, Ramos-Lopez O, Riezu-Boj JI, Milagro FI, and Martinez JA. 2019. Diet, gut microbiota, and obesity: Links with host genetics and epigenetics and potential applications. Adv. Nutr. 10, S17?S30. google schola Huerta-Cepas J, Szklarczyk D, Forslund K, Cook H, Heller D, Walter MC, Rattei T, Mende DR, Sunagawa S, Kuhn M, et al. 2016. eggNOG 4.5: a hierarchical orthology framework with improved functional annotations for eukaryotic, prokaryotic, and viral sequences. Nucleic Acids Res. 4, D286?D293. google schola Khanna S and Tosh PK. 2014. A clinician's primer on the role of the microbiome in human health and disease. Mayo Clin. Proc. 89, 107?114. google schola

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