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Jam-Eon Park (Korea Research Institute of Bioscience and Biotechnology) Ji-Sun Kim (Korea Research Institute of Bioscience and Biotechnology) Seung-Hyeon Choi (Korea Research Institute of Bioscience and Biotechnology) Kook-Il Han (Korea Research Institute of Bioscience and Biotechnology) Se Won Kang (Korea Research Institute of Bioscience and Biotechnology) Ju Huck Lee (Korea Research Institute of Bioscience and Biotechnology) Byeong Seob Oh (Korea Research Institute of Bioscience and Biotechnology) Seung Yeob Yu (Korea Research Institute of Bioscience and Biotechnology) Keun Chul Lee (Korea Research Institute of Bioscience and Biotechnology) Mi Kyung Eom (Korea Research Institute of Bioscience and Biotechnology) Min Kuk Suh (Korea Research Institute of Bioscience and Biotechnology) Han Sol Kim (Korea Research Institute of Bioscience and Biotechnology) Dong Ho Lee (Seoul National University Bundang Hospital) Hyuk Yoon (Seoul National University Bundang Hospital) Byung-Yong Kim (ChunLab) Je Hee Lee (ChunLab) Jung-Sook Lee (Korea Research Institute of Bioscience and Biotechnology) Seung-Hwan Park (Korea Research Institute of Bioscience and Biotechnology)
저널정보
한국미생물학회 미생물학회지 미생물학회지 제56권 제1호
발행연도
2020.3
수록면
94 - 97 (4page)

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본 연구에서는 건강한 한국인 분변 샘플로부터 Blautia sp. KGMB01111 균주를 분리하였으며 PacBio Sequel 플랫폼을 이용하여 유전체서열을 분석하였다. 염색체의 크기는 3,738,517 bp이며, 유전체는 G + C 구성 비율이 44.6 ㏖%, 3,390개의 유전자와 3,154개의 단백질 코딩 유전자, 18개의 rRNA 및 63개 tRNA로 구성되어있다. Blautia sp. KGMB01111 균주는 탄수화물을 이용하여 단쇄지방산 사슬 중 아세트산을 생성하는 것을 확인하였다. KGMB01111 균주에서 탄수화물 발효와 관련된 유전자를 조사하였고 갈락토스와 아미노산을 이용한 아세트산 합성에 관련된 유전자를 포함한다. 이러한 유전체의 분석은 KGMB01111 균주에 의해 생성된 아세트산이 장 내벽 상피세포를 증진시켜 사람의 건강 및 소화에 관여할 것으로 여겨진다.
#Blautia sp. KGMB01111 #draft genome sequence #human faeces #PacBio Sequel #short chain fatty acid

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Aziz RK, Devoid S, Disz T, Edwards RA, Henry CS, Olsen GJ, Olson R, Overbeek R, Parrello B, Pusch GD, et al. 2012. Seed servers: High-performance access to the seed genomes, annotations, and metabolic models. PLoS One 7, e48053. google schola Bairoch A and Apweiler R. 2000. The swiss-prot protein sequence database and its supplement trembl in 2000. Nucleic Acids Res. 28, 45?48. google schola Cuevas-Sierra A, Ramos-Lopez O, Riezu-B oj JI, Milagro FI, and Martinez JA. 2019. Diet, gut microbiota, and obesity: Links with host genetics and epigenetics and potential applications. Adv. Nutr. 10, S17?S30. google schola Gill PA, van Zelm MC, Muir JG, and Gibson PR. 2018. Review article: Short chain fatty acids as potential therapeutic agents in human gastrointestinal and inflammatory disorders. Aliment. Pharmacol. Ther. 48, 15?34. google schola Huerta-Cepas J, Szklarczyk D, Forslund K, Cook H, Heller D, Walter MC, Rattei T, Mende DR, Sunagawa S, Kuhn M, et al. 2016. Eggnog 4.5: A hierarchical orthology framework with improved functional annotations for eukaryotic, prokaryotic and viral sequences. Nucleic Acids Res. 44, D286?293. google schola

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