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자료유형
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저자정보
저널정보
한국육종학회 한국육종학회지 한국육종학회지 제41권 제2호
발행연도
2009.1
수록면
101 - 105 (5page)

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Rice (Oryza sativa L.), the world’s most important crop, is usually classified into ssp. indica and japonica based on morpho-physiological traits. In the previous study, we have developed subspecies-specific STS markers (SS markers) to readily discriminate between indica and japonica in O. sativa. In this study, we employed SS markers to investigate the genomic inclination of worldwide collections of O. sativa. A total of 320 varieties were divided into two groups with 63 SS markers. Namely, they formed two distinctive groups, indica and japonica, as expected by their geographic origin. The population structure analysis revealed that the variability of genetic background was greater in indica than in japonica. Some of them, however, exhibited intermediate genomic inclination between indica and japonica. These results are in general agreement with the previous studies, suggesting that SS markers are powerful tools for both determination of subspecies genome and assessment of genetic diversity in rice.
#Rice #Subspecies-specific marker #Genetic diversity

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Causse MA / 1994 / Saturated molecular map of the rice genome based on an interspecific backcross population / Genetics 138 : 1251 ~ 1274 google schola Cavalli-Sforza LL / 1967 / Phylogenetic analysis: models and estimation procedures / Evolution 32 : 550 ~ 570 google schola Cho YS / 1998 / Comparison of genetic variation among rice varieties detected by RAPD, AFLP, and SSRP / Korean J. Genet. 20 (2) : 117 ~ 127 google schola Garris AJ / 2005 / Genetic structure and diversity of Oryza sativa L / Genetics 169 : 1631 ~ 1638 google schola Harushima Y / 2001 / A genome-wide survey of reproductive barriers in an intraspecific hybrid / Genetics 159 : 883 ~ 892 google schola

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