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본 연구는 MC1R*3 allele의 돼지에 있어서 유전적 변이를 관찰하기 위하여 수행하였다. 일반적으로 흑모색 바탕에 백색반점이나 백색띠를 갖고 있는 돼지의 MC1R 유전자의 유전자형은 ED2 로 나타낸다. 우성 백색계통의 EP 유전자형은 우성 흑모색 계통의 ED2 유전자와 frameshift mutation 관계가 있다. 돼지 MC1R 전체 번역지역을 증폭하기 위하여 oligonucleotide primer를 제작하여 PCR을 수행 하였다. 그 결과 길이가 963~966 base pairs인 돼지 MC1R 유전자의 전체번역지역을 포함하는 산물을 얻었다. 이들 번역부위의 염기서열 결정하고 이들을 Clustal W 프로그램을 이용하여 정렬한 결과 23번 코돈 (nt68)에서 Hampshire와 제주 재래흑돈은 염기 시토신 (cytosine)이 3개 그리고 Birkshire의 경우 염기 시토신(cytosine)이 2개 결실되어 있었다. 그 외에 3개의 missense mutations과 하나의 frameshift mutation이 발견되었다.

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