지원사업
학술연구/단체지원/교육 등 연구자 활동을 지속하도록 DBpia가 지원하고 있어요.
커뮤니티
연구자들이 자신의 연구와 전문성을 널리 알리고, 새로운 협력의 기회를 만들 수 있는 네트워킹 공간이에요.
초록· 키워드
오류제보하기
항독감바이러스 활성을 갖는 그람 양성 종속영양 젖산 간균 Lactobacillus paraplantarum strain CK401의 유전체 서열 분석결과를 실시하였다. 원형의 세균 유전체는 길이는 3,164,408 bp였으며 43.99% G + C 비율을 가지며, 나머지 5개의 원형 플라스미드가 존재하였다: pCK401A (15,102 bp / 37.33% G + C 비율), pCK401B (15,825 bp / 40.58% G + C 비율), pCK401C (12,380 bp / 36.03% G + C 비율), pCK401D (40,656 bp / 42.00% G + C 비율), pCK401E (41,380 bp / 40.12% G + C 비율). 전체 3,179개의 유전자중에 3,088개는 단백질을 코드 하며, 이중에 2,061개는 단백질의 기능이 할당되었다. 유전체는 5개의 16 rRNA 오페론과 71개의 tRNA 유전자를 가지고 있었다. CRISPR 유전자 좌위는 존재하지 않았다. CK401 균주는 해당작용 및 5 탄당인산염 대사 경로가 존재하며, 젖산, 에탄올, 부탄디올 탈수소 효소 및 초산 인산화 효소에 의해 이종발효 대사(heteroferementative metabolism)를 할 것으로 예상된다. 다양한 당가수분해 효소는 47개의 유전자가 17개의 GH families에 속하였으며, 알파-아밀라아제, 알파-/베타-갈락토시다제, 베타-글루코시다제, 베타-글루쿠로니다제, 갈락타나제, 및 인버타제를 포함했다. 일부 알려진 bacteriocin 유전자와 이미 활성을 확인한 히알루론산 유전자를 가지며, 항생제 내성 유전자 또한 존재하지 않는 CK401 균주의 유전체 분석을 통해 이 균주가 잠재력 있는 가축용 프로바이오틱이 될 수 있음을 보여 주었다.
목차
등록된 정보가 없습니다.
참고문헌 (11)
참고문헌 신청
Bland C, Ramsey TL, Sabree F, Lowe M, Brown K, Kyrpides NC, and Hugenholtz P. 2007. CRISPR Recognition Tool (CRT): a tool for automatic detection of clustered regularly interspaced palindromic repeats. BMC Bioinformatics 8, 209.
Breit haupt D E, Schwack W , Wolf G , and Hammes WP. 2001. Characterization of the triterpenoid 4,4'-diaponeurosporene and its isomers in food-associated bacteria. Eur. Food Res. Technol. 213, 231?233.
Chen L, Yang J, Yu J, Yao Z, Sun L, Shen Y, and Jin Q. 2005. VFDB: a reference database for bacterial virulence factors. Nucleic Acids Res. 33, D325?D328.
Chin CS, Alexander DH, Marks P, Klammer AA, Drake J, Heiner C, Clum A, Copeland A, Huddleston J, Eichler EE, et al. 2013. Nonhybrid, finished microbial genome assemblies from longread SMRT sequencing data. Nat. Methods 10, 563?569.
Griffiths-Jones S, Moxon S, Marshall M, Khanna A, Eddy SR, and Bateman A. 2005. Rfam: annotating non-coding RNAs in complete genomes. Nucleic Acids Res. 33, D121?D124.
Breit haupt D E, Schwack W , Wolf G , and Hammes WP. 2001. Characterization of the triterpenoid 4,4'-diaponeurosporene and its isomers in food-associated bacteria. Eur. Food Res. Technol. 213, 231?233.
Chen L, Yang J, Yu J, Yao Z, Sun L, Shen Y, and Jin Q. 2005. VFDB: a reference database for bacterial virulence factors. Nucleic Acids Res. 33, D325?D328.
Chin CS, Alexander DH, Marks P, Klammer AA, Drake J, Heiner C, Clum A, Copeland A, Huddleston J, Eichler EE, et al. 2013. Nonhybrid, finished microbial genome assemblies from longread SMRT sequencing data. Nat. Methods 10, 563?569.
Griffiths-Jones S, Moxon S, Marshall M, Khanna A, Eddy SR, and Bateman A. 2005. Rfam: annotating non-coding RNAs in complete genomes. Nucleic Acids Res. 33, D121?D124.
함께 읽어보면 좋을 논문
논문 유사도에 따라 DBpia 가 추천하는 논문입니다. 함께 보면 좋을 연관 논문을 확인해보세요!
-
Complete Genome Sequence of Lactobacillus paraplantarum CK401
한국미생물학회 학술대회논문집
2020 .10
-
Plasmid profiling of multi-drug resistant Vibrio sp. isolated from influent and effluent water samples of fish farms in Jeju, South Korea
미생물학회지
2018 .03
-
Complete genome sequence of Lactobacillus plantarum SK151 isolated from kimchi
미생물학회지
2018 .09
-
축산농가의 항생제 사용에 따른 다제내성 균의 출현 실태조사 및 연관성 탐구
한국미생물학회 학술대회논문집
2019 .04
-
Complete genome sequence of probiotic Lactobacillus johnsonii IDCC9203 isolated from infant feces
미생물학회지
2019 .12
-
Complete genome sequence of Lactobacillus plantarum JBE245 isolated from Meju
미생물학회지
2017 .12
-
Complete genome sequence of probiotic Lactobacillus helveticus IDCC3801 isolated from infant feces
미생물학회지
2020 .03
-
On the generalizations of Br\"{u}ck conjecture
대한수학회논문집
2016 .01
-
Some results related to differential-difference counterpart of the Br\"{u}ck conjecture
대한수학회논문집
2024 .01
-
Whole genome of strain RR4-35, a novel bacterium in the family Rhodobacteraceae
미생물학회지
2021 .03
-
Protein Kinase CK2 Is Upregulated by Calorie Restriction and Induces Autophagy
Molecules and Cells
2022 .03
-
CRISPR/Cas systems and anti-repeat sequences of Lactobacillus curvatus, Lactobacillus graminis, Lactobacillus fuchuensis, and Lactobacillus sakei genomes
미생물학회지
2021 .03
-
Draft genome sequence of a Sneathiella sp. HT1-7, isolated from coastal seawater
미생물학회지
2021 .12
-
Complete genome sequence of probiotic Lactobacillus plantarum IDCC3501 isolated from kimchi
미생물학회지
2019 .12
-
Reconstruction of Genome-scale Metabolic Network Models of Lactobacillus Species
한국미생물학회 학술대회논문집
2022 .10
-
Complete genome sequence of Sphingomonas sanguinis NP2-R2, a carotenoid producing bacterium, isolated from morning glory
미생물학회지
2021 .09
-
Complete genome sequence of Lactobacillus koreensis 26-25, a ginsenoside converting bacterium, isolated from Korean kimchi
미생물학회지
2018 .12
-
Draft genome sequence of Lactobacillus reuteri KLR3004 from a fattening pig
미생물학회지
2017 .06
-
Complete genome sequence of Parasphingopyxis sp. CP4, an asparaginase-producing marine bacterium
미생물학회지
2020 .12
-
Complete genome sequence of Sphingobacterium sp. SRCM116780, a high vancomycin resistant bacterium, isolated from rice paddy soil
미생물학회지
2024 .06
이 논문의 저자 정보
최근 본 자료
댓글(0)
0