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Rhodobacteraceae 과에 속하는 신종 균주 RR4-35는 해수 순환 여과 양식 시스템(RAS)의 바이오 필터에서 분리되었다. 이 균주는 그 과에 속한 유효명을 가진 종들과 낮은 16S rRNA 유전자 유사도를 보여주었다(< 96.47%). PacBio RS II 분석을 통해 하나의 염색체(3,833,345 bp 크기의 G + C 함량 59.3 mol%)와 여섯 개의 플라스미드 서열이 확인되었다. 이 균주의 유전체들은 총 4,487개의 유전자, 4,436개의 CDS, 47개의 tRNA와 3개의 rRNA 유전자를 포함한다. Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes 분석을 통해 탈질 과정과 벤조에이트 분해와 관련된 유전자 클러스터들이 확인되었다. 본 유전체 분석 결과는 RAS에서 질소 순환과 유기 물질의 분해에 대한 RR4-35 균주의 잠재적인 역할을 보여준다.
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Ardui S, Ameur A, Vermeesch JR, and Hestand MS. 2018. Single molecule real-time (SMRT) sequencing comes of age: applications and utilities for medical diagnostics. Nucleic Acids Res. 46, 2159–2168.
Arndt D, Grant JR, Marcu A, Sajed T, Pon A, Liang Y, and Wishart DS. 2016. PHASTER: A better, faster version of the PHAST phage search tool. Nucleic Acids Res. 44, W16–W21.
Burland SM and Edwards EA. 1999. Anaerobic benzene biodegradation linked to nitrate reduction. Appl. Environ. Microbiol. 65, 529–533.
Chen Z, Chang Z, Zhang L, Jiang Y, Ge H, Song X, Chen S, Zhao F, and Li J. 2019. Effects of water recirculation rate on the microbial community and water quality in relation to the growth and survival of white shrimp (Litopenaeus vannamei). BMC Microbiol. 19, 192.
Garrity G, Brenner DJ, Krieg, NR, and Staley JR. 2005. Bergey’s manual of systematic bacteriology. Volume 2: The Proteobacteria. Springer US, Boston, Massachusetts, USA.
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Burland SM and Edwards EA. 1999. Anaerobic benzene biodegradation linked to nitrate reduction. Appl. Environ. Microbiol. 65, 529–533.
Chen Z, Chang Z, Zhang L, Jiang Y, Ge H, Song X, Chen S, Zhao F, and Li J. 2019. Effects of water recirculation rate on the microbial community and water quality in relation to the growth and survival of white shrimp (Litopenaeus vannamei). BMC Microbiol. 19, 192.
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