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논문 기본 정보
- 자료유형
- 학술대회자료
- 저자정보
- 발행연도
- 2021.10
- 수록면
- 212 - 212 (1page)
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Pumpkin (2n = 2x = 40) is the economically important Cucurbitaceae crops all over the world. Among them, Cucurbita moschata is used for food (young squash) as well as the rootstock for cucumber and watermelon cultivation. In order to develop high-throughput SNP markers for the determination of rapid seed purity from F1 hybrids, genotyping-by-sequencing (GBS) of 167 pumpkin accessions was performed using Illumina Nextseq 500. A Read mapping rate of 83.68% was obtained for the GSB data. Further, SNPs were collected and filtered based on filtering parameter (depth≥5, missing rate≤0.05). A total of 10,549 SNPs were obtained and among them, 396 SNPs were selected based on the stringent filtering parameters such as bi-allelic genotype, single copy number, polymorphism information content ... 전체 초록 보기
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