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본 연구는 홍해삼의 유전체를 분석하여 홍해삼의 유전자 마커 개발을 위한 기초 자료로 활용하기 위해 수행되었다. 울릉도_일반과 울릉도_토착으로 microsatellite marker 분석을 실시하였다. 그 결과 dinucleotide repeat 서열이 81.3~81.4%로 가장 많이 차지 되었으며, 반복서열 개수가 증가될수록 감소되는 경향을 보였다. 일반적으로 microsatellite는 5~10 반복수 사이에 집중적으로 존재하였으며, 반복 서열의 크기가 클수록 반복수가 적어지는 양상을 보였다. Di, tri, tetra-nucleotides 반복에서 각각 (AT)<SUB>5</SUB>, (AAT)<SUB>5</SUB>, (AAAT)<SUB>5</SUB> 등이 가장 높은 것들로 나타났다. (CG), (CCG) 등은 동일 반복 단위의 다른 반복 단위에 비교하여 매우 낮게 관찰되었다. Di-와 tri-nucleotide는 반복수가 각각 35와 32까지 지속적으로 나타난 다음에 비연속적으로 44와 43 반복까지 계수 되었다. Tetra-, penta- 및 hexa-nucleotide는 각각 25, 21 및 14까지 연속적으로 나타났다. 본 분석결과에 따르면 microsatellite는 특이서열반복에 대해 편중되는 경향성을 보이는 것으로 나타났다. 따라서 홍해삼의 microsatellite 분석에서 고유의 반복 서열과 반복수를 유지하는 것으로 추정되므로 향후 연구를 위한 기초 자료로 활용하는 것이 가능할 것으로 판단된다.
목차
서론
재료 및 방법
결과 및 고찰
References
초록
참고문헌 (23)
참고문헌 신청
Bordbar, S., Anwar, F. and Saari, N. 2011. High-value components and bioactives from sea cucumbers for functional foods－A review. Mar. Drugs 9, 1761-1805.
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Choe, S. and Ohshima, Y. 1961. On the morphological and ecological differences between two commercial forms, “Green” and “Red”, of the Japanese common sea cucumber, Stichopus japonicus Selenka. Nippon Suisan Gakkaishi, 27, pp. 105-106.
Cui, F. X., Xue, C. H., Li, Z. J. and Zhang, Y. Q. 2007. Characterization and subunit composition of collagen from the body wall of sea cucumber Stichopus japonicus. Food Chem. 100, 1120-1125.
Desai, H., Hamid, R., Ghorbanzadeh, Z., Bhut, N., Padhiyar, S. M., Kheni, J. and Tomar, R. S. 2021. Genic microsatellite marker characterization and development in little millet (Panicum sumatrense) using transcriptome sequencing. Sci. Rep. 11, 20620.
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