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Hualin Nie (서울시립대학교 환경원예학과) Sujung Kim (Bioenergy Crop Research Institute Institute of Crop Science Rural Development Administration) 김종보 (건국대학교) 권석윤 (한국생명공학연구원) 김선형 (서울시립대학교)
저널정보
한국식물생명공학회 Journal of Plant Biotechnology Journal of Plant Biotechnology 제49권 제1호
발행연도
2022.3
수록면
39 - 45 (7page)
DOI
10.5010/JPB.2022.49.1.039

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Conserved domains are defined as recurring units in molecular evolution and are commonly used to interpret the molecular function and biochemical structure of proteins. Herein, the ADP-glucose pyrophosphorylase (AGPase) amino acid sequences of three species of the Ipomoea genus [Ipomoea trifida, I. triloba, and I. batatas (L.) Lam. (sweetpotato)] were identified to investigate their physicochemical and biochemical characteristics. The molecular weight, isoelectric point, instability index, and grand average of hyropathy markedly differed among the three species. The aliphatic index values of sweetpotato AGPase proteins were higher in the small subunit than in the large subunit. The AGPase proteins from sweetpotato were found to contain an LbH_G1P_AT_C domain in the C-terminal region and various domains (NTP_transferase, ADP_Glucose_PP, or Glyco_tranf_GTA) in the N-terminal region. Conversely, most of its two relatives (I. trifida and I. triloba) were found to only contain the NTP_transferase domain in the N-terminal region. These findings suggested that these conserved domains were species-specific and related to the subunit types of AGPase proteins. The study may enable research on the AGPase-related specific characteristics of sweetpotatoes that do not exist in the other two species, such as starch metabolism and tuberization mechanism.

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