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살모넬라는 오염된 식품을 섭취하였을 때 심각한 질병을 일으킬 수 있는 식품매개 병원균이다. 본 연구에서는 2022년 경상남도 소재 식당에서 발생한 식중독 사고의 원인식품으로 추정되는 계란지단으로부터 분리된 Salmonella strain MFDS1021937의 유전체 분석을 수행하였다. Salmonella enterica serovar Typhimurium MFDS1021937은 4,857,986 bp 길이의 chromosome과 98,402 bp, 93,838 bp 길이의 두 개의 plasmid로 구성되어 있으며, 각각의 G + C contents는 52.2%, 50.4%, 53.1%로 확인되었다. 또한, chromosome에서는 4,859개의 단백질 코딩유전자, 84개 transfer RNA, 그리고 22개의 ribosomal RNA가 예측되었으며 두 개 plasmid에서는 각각 133개, 142개의 단백질 코딩유전자가 확인되었다. MFDS1021937의 유전체 정보는 S. Typhimurium의 독성 및 병원성의 유전적 기초를 밝히는 심층적인 유전적 정보를 제공한다.
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Bortolaia V, Kaas RS, Ruppe E, Roberts MC, Schwarz S, Cattoir V, Philippon A, Allesoe RL, Rebelo AR, Florensa F, et al. 2020. ResFinder 4.0 for predictions of phenotypes from genotypes. J. Antimicrob. Chemother. 75, 3491–3500.
Brettin T, Davis JJ, Disz T, Edwards RA, Gerdes S, Olsen GJ, Olson R, Overbeek R, Parrello B, Pusch GD, et al. 2015. RASTtk: a modular and extensible implementation of the RAST algorithm for building custom annotation pipelines and annotating batches of genomes. Sci. Rep. 5, 1–6.
Hoelzer K, Mereno Switt AI, and Wiedmann M. 2011. Animal contact as a source of human non-typhoidal salmonellosis. Vet. Res. 42, 1–28.
Hu T, Chitnis N, Monos D, and Dinh A. 2021. Next-generation sequencing technologies: An overview. Hum. Immunol. 82, 801–811.
Issenhuth-Jeanjean S, Roggentin P, Mikoleit M, Guibourdenche M, De Pinna E, Nair S, Fields PI, and Weill FX. 2014. Supplement 2008-2010 (no. 48) to the White-Kauffmann-Le Minor scheme. Res. Microbiol. 165, 526–530.
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