경남 양식 돌돔(Oplegnathus fasciatus)과 참돔(Pagrus major)의 Red Sea Bream Iridoviral Disease (RSIVD) 모니터링과 분자적 특성 :Monitoring and Molecular Characterization of Red Sea Bream Iridoviral Disease (RSIVD) Cultured Rock Bream (Oplegnathus fasciatus) and Red Sea Bream (Pagrus major) of Gyeongnam

김경호

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자료유형: 학위논문

저자정보: 김경호 (경상대학교, 경상대학교 대학원)

지도교수: 박찬일

발행연도: 2020

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이용수19

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2020

참돔(Pagrus major) Interferon regulatory factor 3 (IRF3) 유전자의 분자적 특성 및 발현 분석

김경호 , 조동희 , 주민수 외 3명 수산해양교육연구 2020.10 학술저널

경남 양식 돌돔(Oplegnathus fasciatus)과 참돔(Pagrus major)의 Red Sea Bream Iridoviral Disease (RSIVD) 모니터링과 분자적 특성

김경호 해양생명과학과 2020.01 학위논문

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RSIVD는 국내 돌돔과 참돔 양식 산업에 심각한 피해를 끼치는 바이러스성 질병 중 하나이며, RSIVD에 감염되면 비정상적인 유영, 체색흑화 및 출혈, 아가미 점상출혈과 비장비대가 관찰된다. 이러한 질병은 1990년 일본 참돔 양식장에서 처음 발병하였으며, 국내에서는 1998년 8월에 남해안에 있는 해상가두리 양식장의 양식 돌돔에서 처음 발병한 이후, 현재까지 양식 어종뿐만 아니라 자연산 어종에서도 보고되어 많은 경제적 피해를 입히고 있는 중요한 바이러스성 질병이다.
이번 연구에서는 국내 수산생물전염병인 RSIVD의 모니터링을 위해 경상남도 거제시·통영시·남해군에 위치한 돌돔과 참돔 가두리 양식장을 대상으로 RSIVD 검사를 하였다. 실험어는 2019년 6월부터 2019년 10월 초까지 1건당 무작위로 30마리씩 채집하여 총 1,800마리(60건)의 돌돔과 참돔을 채집하였으며, 5마리씩 pooling 하여 모니터링을 수행하였다. RSIVD는 OIE 수산동물진단메뉴얼에 따라 PCR을 수행하여 검출하였으며, 360개의 pooling 샘플 중 89개(24.7%)에서 RSIV가 검출되었다. 그중 돌돔에서는 59개의 pooling 샘플(66.3%)에서 참돔에서는 30개의 pooling 샘플(33.7%)에서 RSIV가 검출되었으며, 상대적으로 돌돔에서 더 많은 RSIV가 검출되었음을 확인하였다. 이번 연구에서 검출된 RSIV는 MCP gene의 염기서열은 모두 동일했으며, GenBank에 등재된 RSIV와 ISKNV 분리주들의 염기서열과 아미노산 서열을 기초로 하여 상동성을 비교한 결과, 우리나라에서 분리된 RBIVKORTY4와 RBIVCNU1보다 일본에서 분리된 RSIVKSTY1과 RSIVU6와 더 밀접하게 군집되어 있었으나, 여전히 우리나라에서 분리된 두 바이러스와 높은 상동성을 확인하였다. RSIV MCP gene의 계통분류학적 분석한 결과, 이번 연구에서 분리된 분리주는 RSIV genotypeⅡ에 속해있음을 확인하였다.

#Red Sea Bream Iridovirus Disease (RSIVD) #Pagrus major #Oplegnathus fasciatus #Monitoring

Ⅰ. 서론 1
Ⅱ. 재료 및 방법 5
1. Fish samples 5
2. Virus detection 7
1) Genomic DNA extraction 7
2) PCR assay for RSIVD 7
3. Cloning and sequence analysis of MCP gene 8
4. Multiple alignment and phylogenetic analysis 10
5. Histopathological analysis 12
Ⅲ. 결과 13
1. Samples information 13
2. PCR results 17
1) Validation of genomic DNA extraction 17
2) Detection of RSIV and ISKNV from fish tissue samples 21
3. Sequence identity of RSIV MCP gene 25
4. Phylogenetic analysis of RSIV 28
5. Histopathological analysis of RSIV infection 29
Ⅳ. 고찰 34
Ⅴ. 요약 39
Ⅵ. 참고문헌 40

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