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논문 기본 정보

자료유형
학술저널
저자정보
저널정보
한국식물생명공학회 Journal of Plant Biotechnology Journal of Plant Biotechnology 제42권 제4호
발행연도
2015.1
수록면
326 - 335 (10page)

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Citrus is an economically important fruit tree with the largest amount of fruit production in the world. It provides important nutrition such as vitamin C and other health-promoting compounds including its unique flavonoids for human health. However, it is classified into the most difficult crops to develop new cultivars through conventional breeding approaches due to its long juvenility and some unique reproductive biological features such as gamete sterility, nucellar embryony, and high level of heterozygosity. Due to global warming and changes in consumer trends, establishing a systematic and efficient breeding programs is highly required for sustainable production of high quality fruits and diversification of cultivars. Recently, reference genome sequences of sweet orange and clementine mandarin have been released. Based on the reference whole-genome sequences, comparative genomics, reference-guided resequencing, and genotyping-by-sequencing for various citrus cultivars and crosses could be performed for the advance of functional genomics and development of traits-related molecular markers. In addition, a full understanding of gene function and gene co-expression networks can be provided through combined analysis of various transcriptome data. Analytic information on whole-genome and transcriptome will provide massive data on polymorphic molecular markers such as SNP, INDEL, and SSR, suggesting that it is possible to construct integrated maps and high-density genetic maps as well as physical maps. In the near future, integrated maps will be useful for map-based precise cloning of genes that are specific to citrus with major agronomic traits to facilitate rapid and efficient marker-assisted selection.
#Citrus #Genome #Transcriptome #Molecular Markers #Genetic Map #Molecular Breeding

목차

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참고문헌 (24)

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Asins MJ / 2012 / The position of the major QTL for citrus tristeza virus resistance is conserved among Citrus grandis, C. aurantium and Poncirus trifoliata / Mol Breed 29 : google schola Bastianel M / 2009 / Quantitative trait loci analysis of citrus leprosis resistance in an interspecific backcross family of (Citrus reticulata Blanco x C. sinensis L. Osbeck) google schola Benavente-Garcia O / 2008 / Update on uses and properties of citrus flavonoids: new findings in anticancer, cardiovascular, and anti-inflammatory activity / J Agric Food Chem google schola Biswas MK / 2014 / Genome wide characterization of short tandem repeat markers in sweet orange (Citrus sinensis) / PLoS One 9 : e104182 ~ google schola Carbonell-Caballero J / 2015 / A phylogenetic analysis of 34 chloroplast genomes elucidates the relationships between wild and domestic species within the genus Citrus / Mol google schola

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