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저자정보
저널정보
대한진단검사의학회 Laboratory Medicine Online Laboratory Medicine Online 제6권 제3호
발행연도
2016.1
수록면
165 - 170 (6page)

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배경: 거대세포바이러스(cytomegalovirus, CMV)와 엡스타인바바이러스(Epstein-Barr virus, EBV) 국제 표준물질이 이용 가능해짐으로써, CMV와 EBV 정량 PCR (qPCR)의 표준화는 향상되었지만, 핵산 추출 방법 또한 qPCR 결과에 영향을 줄 수 있다. 이 연구에서는 바이러스 qPCR 전에 DNA 농도와 순도 측정이 일상적으로 필요한지를 살펴보았으며, 수기법인 QIAamp DNA Blood Mini 키트(키트(Qiagen, USA)와 자동화법인 QIASymphony DSP DNA Mini 키트(Qiagen)를 비교하여 핵산 추출법을 도입할 때 고려해야 할 사항을 살펴보고자 하였다. 방법: DNA 정량과 순도는 QIAamp DNA Blood Mini 키트로 수기 추출한 후 EBV qPCR을 시행한 300개 전혈 DNA를 대상으로 하였으며, NanoDrop ND-1000 Spectrophotometer (Thermo Scientific, USA)에서 측정하였다. 수기 핵산추출과 자동화된 핵산추출의 비교는 CMV qPCR이 의뢰된 72개의 전혈과 EBV qPCR이 의뢰된 54개의 전혈을 대상으로 하였다. CMV와 EBV DNA는 artus CMV 및 Artus EBV PCR로 정량하였다. 결과: DNA 농도와 EBV DNA 정량값 사이에는 일관된 상관성이 없었으며, DNA 순도와 Cq (내부대조물질의 Cq값에서 동일한 qPCR 배치에서 사용한 음성 대조검체에 첨가한 내부대조물질의 Cq값을 뺀 값) 사이에는 상관성이 없었다. 수기 핵산추출과 자동화된 핵산추출 후 CMV와 EBV qPCR값은 두 방법 간에 높은 상관 관계가 있었다(CMV, rho=0.946; EBV, rho=0.887). 두 방법 모두에서 CMV DNA가 양성이었던 29검체 중 8검체(27.6%)는 QIASymphony에서 추출한 핵산 정량값이 유의하게 높았다. 결론: 검사실에서 CMV와 EBV qPCR 전에 일상적으로 DNA 농도와 순도를 측정할 필요는 없을 것으로 판단되었다. 전혈에서 CMV와 EBV DNA를 추출할 때 자동화 기기인 QIASymphony법의 정량값이 수기법인 QIAamp DNA Blood Mini 키트보다 유의하게 높았다.
#Nucleic acid extraction #Cytomegalovirus #Epstein-Barr virus #MIQE guideline

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참고문헌 (25)

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Razonable RR / 2004 / Management of CMV infection and disease in transplant patients / Herpes 11:77~86 google schola Cherikh WS / 2003 / Association of the type of induction immunosuppression with posttransplant lymphoproliferative disorder, graft survival, and patient survival after primary kidney transplantation / Transplantation 76:1289~1293 google schola Baldanti F / 2008 / Monitoring human cytomegalovirus in fection in transplant recipients / J Clin Virol 41:237~241 google schola Gärtner B / 2010 / EBV viral load detection in clinical virology / J Clin Virol 48:82~90 google schola Hodinka RL / 2011 / Manual of clinical microbiology / ASM Press :1558~1574 google schola

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